CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs/041.mrc Output diagnostic file name Micrographs/041.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 360 35.0 5.0 8000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs/041.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2260.000 8208.000 Mean, RMS : 4279.080 222.4178 TITLE 1: emi2mrc: 041.emi Sun Jan 19 14:35:54 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 23630, Spot 4, Int 55.14%, Obj 88.04%, Dif 73.67% TITLE 3: X 268.871, Y -479.126, Z -58.933, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 121 120 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 8000.00 8000.00 0.00 -0.03303 18000.00 8000.00 0.00 -0.03241 18200.00 8000.00 0.00 -0.03162 18400.00 8000.00 0.00 -0.03072 18600.00 8000.00 0.00 -0.02969 18800.00 8000.00 0.00 -0.02858 19000.00 8000.00 0.00 -0.02744 19200.00 8000.00 0.00 -0.02634 19400.00 8000.00 0.00 -0.02530 19600.00 8000.00 0.00 -0.02431 19800.00 8000.00 0.00 -0.02332 20000.00 8000.00 0.00 -0.02227 20200.00 8000.00 0.00 -0.02114 20400.00 8000.00 0.00 -0.01992 20600.00 8000.00 0.00 -0.01865 20800.00 8000.00 0.00 -0.01735 21000.00 8000.00 0.00 -0.01602 21200.00 8000.00 0.00 -0.01467 21400.00 8000.00 0.00 -0.01329 21600.00 8000.00 0.00 -0.01186 21800.00 8000.00 0.00 -0.01040 22000.00 8000.00 0.00 -0.00892 22200.00 8000.00 0.00 -0.00746 22400.00 8000.00 0.00 -0.00601 22600.00 8000.00 0.00 -0.00455 22800.00 8000.00 0.00 -0.00304 23000.00 8000.00 0.00 -0.00148 23200.00 8000.00 0.00 0.00011 23400.00 8000.00 0.00 0.00169 23600.00 8000.00 0.00 0.00321 23800.00 8000.00 0.00 0.00469 24000.00 8000.00 0.00 0.00618 24200.00 8000.00 0.00 0.00775 24400.00 8000.00 0.00 0.00943 24600.00 8000.00 0.00 0.01120 24800.00 8000.00 0.00 0.01303 25000.00 8000.00 0.00 0.01488 25200.00 8000.00 0.00 0.01683 25400.00 8000.00 0.00 0.01898 25600.00 8000.00 0.00 0.02144 25800.00 8000.00 0.00 0.02421 26000.00 8000.00 0.00 0.02712 26200.00 8000.00 0.00 0.02989 26400.00 8000.00 0.00 0.03225 26600.00 8000.00 0.00 0.03400 26800.00 8000.00 0.00 0.03509 27000.00 8000.00 0.00 0.03565 27200.00 8000.00 0.00 0.03585 27000.00 8200.00 0.00 0.03610 27200.00 8200.00 0.00 0.03629 27000.00 8400.00 0.00 0.03654 27200.00 8400.00 0.00 0.03673 27000.00 8600.00 0.00 0.03699 27200.00 8600.00 0.00 0.03718 27000.00 8800.00 0.00 0.03743 27200.00 8800.00 0.00 0.03762 27000.00 9000.00 0.00 0.03779 27200.00 9000.00 0.00 0.03799 27000.00 9200.00 0.00 0.03808 27200.00 9200.00 0.00 0.03830 27400.00 9200.00 0.00 0.03831 27000.00 9400.00 0.00 0.03831 27200.00 9400.00 0.00 0.03856 27400.00 9400.00 0.00 0.03859 27200.00 9600.00 0.00 0.03884 27400.00 9600.00 0.00 0.03890 27000.00 9800.00 0.00 0.03892 27200.00 9800.00 0.00 0.03923 27400.00 9800.00 0.00 0.03930 27000.00 10000.00 0.00 0.03939 27200.00 10000.00 0.00 0.03972 27400.00 10000.00 0.00 0.03980 27000.00 10200.00 0.00 0.03989 27200.00 10200.00 0.00 0.04023 27400.00 10200.00 0.00 0.04031 27000.00 10400.00 0.00 0.04037 27200.00 10400.00 0.00 0.04072 27400.00 10400.00 0.00 0.04080 27000.00 10600.00 0.00 0.04084 27200.00 10600.00 0.00 0.04119 27400.00 10600.00 0.00 0.04127 27000.00 10800.00 0.00 0.04133 27200.00 10800.00 0.00 0.04168 27400.00 10800.00 0.00 0.04175 27000.00 11000.00 0.00 0.04192 27200.00 11000.00 0.00 0.04226 27400.00 11000.00 0.00 0.04232 27000.00 11200.00 0.00 0.04266 27200.00 11200.00 0.00 0.04298 27400.00 11200.00 0.00 0.04303 27000.00 11400.00 0.00 0.04349 27200.00 11400.00 0.00 0.04379 27400.00 11400.00 0.00 0.04383 27000.00 11600.00 0.00 0.04430 27200.00 11600.00 0.00 0.04459 27400.00 11600.00 0.00 0.04461 27000.00 11800.00 0.00 0.04504 27200.00 11800.00 0.00 0.04531 27400.00 11800.00 0.00 0.04531 27000.00 12000.00 0.00 0.04570 27200.00 12000.00 0.00 0.04595 27000.00 12200.00 0.00 0.04635 27200.00 12200.00 0.00 0.04657 27000.00 12400.00 0.00 0.04706 27200.00 12400.00 0.00 0.04727 27000.00 12600.00 0.00 0.04785 27200.00 12600.00 0.00 0.04804 27000.00 12800.00 0.00 0.04862 27200.00 12800.00 0.00 0.04880 27000.00 13000.00 0.00 0.04929 27200.00 13000.00 0.00 0.04948 27000.00 13200.00 0.00 0.04986 27200.00 13200.00 0.00 0.05005 27000.00 13400.00 0.00 0.05039 27200.00 13400.00 0.00 0.05061 27400.00 13400.00 0.00 0.05061 27000.00 13600.00 0.00 0.05105 27200.00 13600.00 0.00 0.05130 27400.00 13600.00 0.00 0.05132 27000.00 13800.00 0.00 0.05197 27200.00 13800.00 0.00 0.05224 27400.00 13800.00 0.00 0.05227 26800.00 14000.00 0.00 0.05245 27000.00 14000.00 0.00 0.05312 27200.00 14000.00 0.00 0.05339 27400.00 14000.00 0.00 0.05342 26800.00 14200.00 0.00 0.05375 27000.00 14200.00 0.00 0.05442 27200.00 14200.00 0.00 0.05468 27400.00 14200.00 0.00 0.05468 26800.00 14400.00 0.00 0.05508 27000.00 14400.00 0.00 0.05573 27200.00 14400.00 0.00 0.05596 26800.00 14600.00 0.00 0.05633 27000.00 14600.00 0.00 0.05695 27200.00 14600.00 0.00 0.05715 26800.00 14800.00 0.00 0.05751 27000.00 14800.00 0.00 0.05810 27200.00 14800.00 0.00 0.05828 26800.00 15000.00 0.00 0.05870 27000.00 15000.00 0.00 0.05927 27200.00 15000.00 0.00 0.05942 26800.00 15200.00 0.00 0.05990 27000.00 15200.00 0.00 0.06046 27200.00 15200.00 0.00 0.06060 26800.00 15400.00 0.00 0.06110 27000.00 15400.00 0.00 0.06164 27200.00 15400.00 0.00 0.06178 26800.00 15600.00 0.00 0.06227 27000.00 15600.00 0.00 0.06281 27200.00 15600.00 0.00 0.06294 26800.00 15800.00 0.00 0.06339 27000.00 15800.00 0.00 0.06392 27200.00 15800.00 0.00 0.06405 26800.00 16000.00 0.00 0.06450 27000.00 16000.00 0.00 0.06502 27200.00 16000.00 0.00 0.06514 26800.00 16200.00 0.00 0.06572 27000.00 16200.00 0.00 0.06623 27200.00 16200.00 0.00 0.06635 26800.00 16400.00 0.00 0.06711 27000.00 16400.00 0.00 0.06762 27200.00 16400.00 0.00 0.06775 26800.00 16600.00 0.00 0.06865 27000.00 16600.00 0.00 0.06916 27200.00 16600.00 0.00 0.06930 26800.00 16800.00 0.00 0.07026 27000.00 16800.00 0.00 0.07078 27200.00 16800.00 0.00 0.07091 26800.00 17000.00 0.00 0.07184 27000.00 17000.00 0.00 0.07235 27200.00 17000.00 0.00 0.07249 26800.00 17200.00 0.00 0.07331 27000.00 17200.00 0.00 0.07383 27200.00 17200.00 0.00 0.07396 26800.00 17400.00 0.00 0.07476 27000.00 17400.00 0.00 0.07528 27200.00 17400.00 0.00 0.07542 26800.00 17600.00 0.00 0.07628 27000.00 17600.00 0.00 0.07682 27200.00 17600.00 0.00 0.07696 26800.00 17800.00 0.00 0.07791 27000.00 17800.00 0.00 0.07847 27200.00 17800.00 0.00 0.07862 26800.00 18000.00 0.00 0.07965 27000.00 18000.00 0.00 0.08023 27200.00 18000.00 0.00 0.08038 26800.00 18200.00 0.00 0.08147 27000.00 18200.00 0.00 0.08206 27200.00 18200.00 0.00 0.08219 26800.00 18400.00 0.00 0.08329 27000.00 18400.00 0.00 0.08388 27200.00 18400.00 0.00 0.08400 26800.00 18600.00 0.00 0.08516 27000.00 18600.00 0.00 0.08575 27200.00 18600.00 0.00 0.08585 26600.00 18800.00 0.00 0.08593 26800.00 18800.00 0.00 0.08717 27000.00 18800.00 0.00 0.08775 27200.00 18800.00 0.00 0.08783 26600.00 19000.00 0.00 0.08808 26800.00 19000.00 0.00 0.08933 27000.00 19000.00 0.00 0.08990 27200.00 19000.00 0.00 0.08996 26600.00 19200.00 0.00 0.09035 26800.00 19200.00 0.00 0.09159 27000.00 19200.00 0.00 0.09215 27200.00 19200.00 0.00 0.09218 26600.00 19400.00 0.00 0.09266 26800.00 19400.00 0.00 0.09390 27000.00 19400.00 0.00 0.09444 27200.00 19400.00 0.00 0.09445 26600.00 19600.00 0.00 0.09491 26800.00 19600.00 0.00 0.09615 27000.00 19600.00 0.00 0.09667 26600.00 19800.00 0.00 0.09706 26800.00 19800.00 0.00 0.09828 27000.00 19800.00 0.00 0.09878 26600.00 20000.00 0.00 0.09922 26800.00 20000.00 0.00 0.10042 27000.00 20000.00 0.00 0.10088 26600.00 20200.00 0.00 0.10144 26800.00 20200.00 0.00 0.10261 27000.00 20200.00 0.00 0.10301 26600.00 20400.00 0.00 0.10368 26800.00 20400.00 0.00 0.10479 27000.00 20400.00 0.00 0.10511 26600.00 20600.00 0.00 0.10591 26800.00 20600.00 0.00 0.10694 27000.00 20600.00 0.00 0.10719 26600.00 20800.00 0.00 0.10805 26800.00 20800.00 0.00 0.10902 27000.00 20800.00 0.00 0.10921 26600.00 21000.00 0.00 0.11003 26800.00 21000.00 0.00 0.11095 27000.00 21000.00 0.00 0.11111 26600.00 21200.00 0.00 0.11195 26800.00 21200.00 0.00 0.11285 27000.00 21200.00 0.00 0.11297 26600.00 21400.00 0.00 0.11392 26800.00 21400.00 0.00 0.11480 27000.00 21400.00 0.00 0.11491 26600.00 21600.00 0.00 0.11594 26800.00 21600.00 0.00 0.11681 27000.00 21600.00 0.00 0.11691 26600.00 21800.00 0.00 0.11802 26800.00 21800.00 0.00 0.11889 27000.00 21800.00 0.00 0.11899 26600.00 22000.00 0.00 0.12018 26800.00 22000.00 0.00 0.12106 27000.00 22000.00 0.00 0.12115 26600.00 22200.00 0.00 0.12234 26800.00 22200.00 0.00 0.12322 27000.00 22200.00 0.00 0.12329 26600.00 22400.00 0.00 0.12453 26800.00 22400.00 0.00 0.12541 27000.00 22400.00 0.00 0.12544 26600.00 22600.00 0.00 0.12689 26800.00 22600.00 0.00 0.12775 26600.00 22800.00 0.00 0.12940 26800.00 22800.00 0.00 0.13023 26600.00 23000.00 0.00 0.13198 26800.00 23000.00 0.00 0.13277 26600.00 23200.00 0.00 0.13464 26800.00 23200.00 0.00 0.13539 26400.00 23400.00 0.00 0.13547 26600.00 23400.00 0.00 0.13733 26800.00 23400.00 0.00 0.13802 26400.00 23600.00 0.00 0.13820 26600.00 23600.00 0.00 0.14001 26800.00 23600.00 0.00 0.14063 26400.00 23800.00 0.00 0.14112 26600.00 23800.00 0.00 0.14287 26800.00 23800.00 0.00 0.14339 26400.00 24000.00 0.00 0.14431 26600.00 24000.00 0.00 0.14598 26800.00 24000.00 0.00 0.14639 26400.00 24200.00 0.00 0.14765 26600.00 24200.00 0.00 0.14923 26800.00 24200.00 0.00 0.14950 26400.00 24400.00 0.00 0.15108 26600.00 24400.00 0.00 0.15254 26800.00 24400.00 0.00 0.15267 26400.00 24600.00 0.00 0.15447 26600.00 24600.00 0.00 0.15581 26400.00 24800.00 0.00 0.15769 26600.00 24800.00 0.00 0.15890 26400.00 25000.00 0.00 0.16088 26600.00 25000.00 0.00 0.16193 26200.00 25200.00 0.00 0.16199 26400.00 25200.00 0.00 0.16427 26600.00 25200.00 0.00 0.16512 26200.00 25400.00 0.00 0.16573 26400.00 25400.00 0.00 0.16780 26600.00 25400.00 0.00 0.16838 26200.00 25600.00 0.00 0.16956 26400.00 25600.00 0.00 0.17133 26600.00 25600.00 0.00 0.17160 26200.00 25800.00 0.00 0.17328 26400.00 25800.00 0.00 0.17468 26200.00 26000.00 0.00 0.17628 26400.00 26000.00 0.00 0.17724 26200.00 26200.00 0.00 0.17802 26400.00 26200.00 0.00 0.17856 26400.00 26400.00 0.00 0.17865 26200.00 26400.00 10.00 0.17875 26200.00 26400.00 15.00 0.17886 26200.00 26400.00 20.00 0.17896 26200.00 26400.00 25.00 0.17905 26200.00 26400.00 30.00 0.17912 26200.00 26400.00 35.00 0.17917 26200.00 26400.00 40.00 0.17921 26200.00 26400.00 45.00 0.17922 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 26186.14 26488.02 44.21 0.17936 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs/041.ctf NX, NY, NZ: 360 360 1 MODE : real