CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs/235.mrc Output diagnostic file name Micrographs/235.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 360 35.0 5.0 8000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs/235.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2260.000 8256.000 Mean, RMS : 4395.995 221.9845 TITLE 1: emi2mrc: 235.emi Sun Jan 19 22:19:35 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 22640, Spot 4, Int 55.12%, Obj 88.08%, Dif 73.67% TITLE 3: X -477.112, Y 545.619, Z -24.116, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 121 120 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 8000.00 8000.00 0.00 -0.01926 8200.00 8000.00 0.00 -0.01905 8400.00 8000.00 0.00 -0.01862 8600.00 8000.00 0.00 -0.01818 8800.00 8000.00 0.00 -0.01789 9000.00 8000.00 0.00 -0.01777 10000.00 8000.00 0.00 -0.01776 10200.00 8000.00 0.00 -0.01750 10400.00 8000.00 0.00 -0.01714 10600.00 8000.00 0.00 -0.01673 10800.00 8000.00 0.00 -0.01631 11000.00 8000.00 0.00 -0.01587 11200.00 8000.00 0.00 -0.01541 11400.00 8000.00 0.00 -0.01489 11600.00 8000.00 0.00 -0.01428 11800.00 8000.00 0.00 -0.01357 12000.00 8000.00 0.00 -0.01282 12200.00 8000.00 0.00 -0.01207 12400.00 8000.00 0.00 -0.01136 12600.00 8000.00 0.00 -0.01067 12800.00 8000.00 0.00 -0.00992 13000.00 8000.00 0.00 -0.00905 13200.00 8000.00 0.00 -0.00803 13400.00 8000.00 0.00 -0.00690 13600.00 8000.00 0.00 -0.00575 13800.00 8000.00 0.00 -0.00462 14000.00 8000.00 0.00 -0.00352 14200.00 8000.00 0.00 -0.00239 14400.00 8000.00 0.00 -0.00115 14600.00 8000.00 0.00 0.00024 14800.00 8000.00 0.00 0.00180 15000.00 8000.00 0.00 0.00351 15200.00 8000.00 0.00 0.00532 15400.00 8000.00 0.00 0.00724 15600.00 8000.00 0.00 0.00925 15800.00 8000.00 0.00 0.01133 16000.00 8000.00 0.00 0.01345 16200.00 8000.00 0.00 0.01557 16400.00 8000.00 0.00 0.01772 16600.00 8000.00 0.00 0.01993 16800.00 8000.00 0.00 0.02222 17000.00 8000.00 0.00 0.02464 17200.00 8000.00 0.00 0.02713 17400.00 8000.00 0.00 0.02961 17600.00 8000.00 0.00 0.03205 17800.00 8000.00 0.00 0.03440 18000.00 8000.00 0.00 0.03669 18200.00 8000.00 0.00 0.03898 18400.00 8000.00 0.00 0.04134 18600.00 8000.00 0.00 0.04379 18800.00 8000.00 0.00 0.04637 19000.00 8000.00 0.00 0.04905 19200.00 8000.00 0.00 0.05182 19400.00 8000.00 0.00 0.05464 19600.00 8000.00 0.00 0.05744 19800.00 8000.00 0.00 0.06013 20000.00 8000.00 0.00 0.06259 20200.00 8000.00 0.00 0.06470 20400.00 8000.00 0.00 0.06634 20600.00 8000.00 0.00 0.06751 20800.00 8000.00 0.00 0.06829 21000.00 8000.00 0.00 0.06877 21200.00 8000.00 0.00 0.06911 21400.00 8000.00 0.00 0.06942 21600.00 8000.00 0.00 0.06967 21800.00 8000.00 0.00 0.06983 22000.00 8000.00 0.00 0.06988 21200.00 8200.00 0.00 0.06990 21400.00 8200.00 0.00 0.07021 21600.00 8200.00 0.00 0.07047 21800.00 8200.00 0.00 0.07064 22000.00 8200.00 0.00 0.07071 21400.00 8400.00 0.00 0.07097 21600.00 8400.00 0.00 0.07124 21800.00 8400.00 0.00 0.07143 22000.00 8400.00 0.00 0.07150 21400.00 8600.00 0.00 0.07178 21600.00 8600.00 0.00 0.07208 21800.00 8600.00 0.00 0.07227 22000.00 8600.00 0.00 0.07235 21400.00 8800.00 0.00 0.07264 21600.00 8800.00 0.00 0.07296 21800.00 8800.00 0.00 0.07317 22000.00 8800.00 0.00 0.07325 21400.00 9000.00 0.00 0.07349 21600.00 9000.00 0.00 0.07383 21800.00 9000.00 0.00 0.07405 22000.00 9000.00 0.00 0.07412 21400.00 9200.00 0.00 0.07435 21600.00 9200.00 0.00 0.07471 21800.00 9200.00 0.00 0.07494 22000.00 9200.00 0.00 0.07501 21400.00 9400.00 0.00 0.07524 21600.00 9400.00 0.00 0.07561 21800.00 9400.00 0.00 0.07584 22000.00 9400.00 0.00 0.07590 21400.00 9600.00 0.00 0.07622 21600.00 9600.00 0.00 0.07659 21800.00 9600.00 0.00 0.07681 22000.00 9600.00 0.00 0.07685 21200.00 9800.00 0.00 0.07694 21400.00 9800.00 0.00 0.07741 21600.00 9800.00 0.00 0.07778 21800.00 9800.00 0.00 0.07798 22000.00 9800.00 0.00 0.07798 21200.00 10000.00 0.00 0.07837 21400.00 10000.00 0.00 0.07883 21600.00 10000.00 0.00 0.07918 21800.00 10000.00 0.00 0.07935 21000.00 10200.00 0.00 0.07937 21200.00 10200.00 0.00 0.07989 21400.00 10200.00 0.00 0.08033 21600.00 10200.00 0.00 0.08065 21800.00 10200.00 0.00 0.08079 21000.00 10400.00 0.00 0.08087 21200.00 10400.00 0.00 0.08138 21400.00 10400.00 0.00 0.08180 21600.00 10400.00 0.00 0.08210 21800.00 10400.00 0.00 0.08221 21000.00 10600.00 0.00 0.08227 21200.00 10600.00 0.00 0.08278 21400.00 10600.00 0.00 0.08319 21600.00 10600.00 0.00 0.08347 21800.00 10600.00 0.00 0.08356 21200.00 10800.00 0.00 0.08407 21400.00 10800.00 0.00 0.08449 21600.00 10800.00 0.00 0.08477 21800.00 10800.00 0.00 0.08484 21000.00 11000.00 0.00 0.08489 21200.00 11000.00 0.00 0.08542 21400.00 11000.00 0.00 0.08584 21600.00 11000.00 0.00 0.08611 21800.00 11000.00 0.00 0.08617 21000.00 11200.00 0.00 0.08642 21200.00 11200.00 0.00 0.08697 21400.00 11200.00 0.00 0.08739 21600.00 11200.00 0.00 0.08764 21800.00 11200.00 0.00 0.08768 21000.00 11400.00 0.00 0.08814 21200.00 11400.00 0.00 0.08869 21400.00 11400.00 0.00 0.08908 21600.00 11400.00 0.00 0.08931 21800.00 11400.00 0.00 0.08932 21000.00 11600.00 0.00 0.08992 21200.00 11600.00 0.00 0.09045 21400.00 11600.00 0.00 0.09082 21600.00 11600.00 0.00 0.09101 21000.00 11800.00 0.00 0.09166 21200.00 11800.00 0.00 0.09216 21400.00 11800.00 0.00 0.09249 21600.00 11800.00 0.00 0.09264 21000.00 12000.00 0.00 0.09329 21200.00 12000.00 0.00 0.09375 21400.00 12000.00 0.00 0.09404 21600.00 12000.00 0.00 0.09414 20800.00 12200.00 0.00 0.09417 21000.00 12200.00 0.00 0.09488 21200.00 12200.00 0.00 0.09531 21400.00 12200.00 0.00 0.09556 21600.00 12200.00 0.00 0.09561 20800.00 12400.00 0.00 0.09596 21000.00 12400.00 0.00 0.09665 21200.00 12400.00 0.00 0.09704 21400.00 12400.00 0.00 0.09725 21600.00 12400.00 0.00 0.09726 20800.00 12600.00 0.00 0.09805 21000.00 12600.00 0.00 0.09871 21200.00 12600.00 0.00 0.09907 21400.00 12600.00 0.00 0.09925 20600.00 12800.00 0.00 0.09936 20800.00 12800.00 0.00 0.10041 21000.00 12800.00 0.00 0.10104 21200.00 12800.00 0.00 0.10138 21400.00 12800.00 0.00 0.10154 20600.00 13000.00 0.00 0.10196 20800.00 13000.00 0.00 0.10299 21000.00 13000.00 0.00 0.10361 21200.00 13000.00 0.00 0.10393 21400.00 13000.00 0.00 0.10408 20600.00 13200.00 0.00 0.10465 20800.00 13200.00 0.00 0.10567 21000.00 13200.00 0.00 0.10628 21200.00 13200.00 0.00 0.10659 21400.00 13200.00 0.00 0.10673 20600.00 13400.00 0.00 0.10736 20800.00 13400.00 0.00 0.10837 21000.00 13400.00 0.00 0.10897 21200.00 13400.00 0.00 0.10927 21400.00 13400.00 0.00 0.10940 20600.00 13600.00 0.00 0.11018 20800.00 13600.00 0.00 0.11118 21000.00 13600.00 0.00 0.11177 21200.00 13600.00 0.00 0.11206 21400.00 13600.00 0.00 0.11217 20600.00 13800.00 0.00 0.11317 20800.00 13800.00 0.00 0.11417 21000.00 13800.00 0.00 0.11474 21200.00 13800.00 0.00 0.11501 21400.00 13800.00 0.00 0.11510 20600.00 14000.00 0.00 0.11625 20800.00 14000.00 0.00 0.11722 21000.00 14000.00 0.00 0.11777 21200.00 14000.00 0.00 0.11802 21400.00 14000.00 0.00 0.11808 20600.00 14200.00 0.00 0.11930 20800.00 14200.00 0.00 0.12026 21000.00 14200.00 0.00 0.12080 21200.00 14200.00 0.00 0.12102 21400.00 14200.00 0.00 0.12103 20600.00 14400.00 0.00 0.12224 20800.00 14400.00 0.00 0.12318 21000.00 14400.00 0.00 0.12370 21200.00 14400.00 0.00 0.12389 20600.00 14600.00 0.00 0.12495 20800.00 14600.00 0.00 0.12589 21000.00 14600.00 0.00 0.12638 21200.00 14600.00 0.00 0.12651 20600.00 14800.00 0.00 0.12756 20800.00 14800.00 0.00 0.12848 21000.00 14800.00 0.00 0.12893 21200.00 14800.00 0.00 0.12899 20600.00 15000.00 0.00 0.13028 20800.00 15000.00 0.00 0.13118 21000.00 15000.00 0.00 0.13159 21200.00 15000.00 0.00 0.13159 20400.00 15200.00 0.00 0.13176 20600.00 15200.00 0.00 0.13317 20800.00 15200.00 0.00 0.13405 21000.00 15200.00 0.00 0.13442 20400.00 15400.00 0.00 0.13481 20600.00 15400.00 0.00 0.13622 20800.00 15400.00 0.00 0.13709 21000.00 15400.00 0.00 0.13741 20400.00 15600.00 0.00 0.13803 20600.00 15600.00 0.00 0.13944 20800.00 15600.00 0.00 0.14029 21000.00 15600.00 0.00 0.14056 20400.00 15800.00 0.00 0.14127 20600.00 15800.00 0.00 0.14268 20800.00 15800.00 0.00 0.14350 21000.00 15800.00 0.00 0.14370 20400.00 16000.00 0.00 0.14452 20600.00 16000.00 0.00 0.14591 20800.00 16000.00 0.00 0.14668 21000.00 16000.00 0.00 0.14680 20400.00 16200.00 0.00 0.14794 20600.00 16200.00 0.00 0.14931 20800.00 16200.00 0.00 0.15001 21000.00 16200.00 0.00 0.15005 20400.00 16400.00 0.00 0.15159 20600.00 16400.00 0.00 0.15291 20800.00 16400.00 0.00 0.15353 20400.00 16600.00 0.00 0.15533 20600.00 16600.00 0.00 0.15658 20800.00 16600.00 0.00 0.15711 20200.00 16800.00 0.00 0.15717 20400.00 16800.00 0.00 0.15910 20600.00 16800.00 0.00 0.16027 20800.00 16800.00 0.00 0.16071 20200.00 17000.00 0.00 0.16094 20400.00 17000.00 0.00 0.16281 20600.00 17000.00 0.00 0.16391 20800.00 17000.00 0.00 0.16424 20200.00 17200.00 0.00 0.16457 20400.00 17200.00 0.00 0.16638 20600.00 17200.00 0.00 0.16739 20800.00 17200.00 0.00 0.16762 20200.00 17400.00 0.00 0.16827 20400.00 17400.00 0.00 0.17002 20600.00 17400.00 0.00 0.17093 20800.00 17400.00 0.00 0.17105 20200.00 17600.00 0.00 0.17226 20400.00 17600.00 0.00 0.17393 20600.00 17600.00 0.00 0.17475 20800.00 17600.00 0.00 0.17476 20200.00 17800.00 0.00 0.17646 20400.00 17800.00 0.00 0.17805 20600.00 17800.00 0.00 0.17876 20200.00 18000.00 0.00 0.18074 20400.00 18000.00 0.00 0.18224 20600.00 18000.00 0.00 0.18285 20200.00 18200.00 0.00 0.18497 20400.00 18200.00 0.00 0.18638 20600.00 18200.00 0.00 0.18688 20200.00 18400.00 0.00 0.18896 20400.00 18400.00 0.00 0.19029 20600.00 18400.00 0.00 0.19066 20000.00 18600.00 0.00 0.19078 20200.00 18600.00 0.00 0.19290 20400.00 18600.00 0.00 0.19412 20600.00 18600.00 0.00 0.19433 20000.00 18800.00 0.00 0.19523 20200.00 18800.00 0.00 0.19723 20400.00 18800.00 0.00 0.19829 20600.00 18800.00 0.00 0.19830 20000.00 19000.00 0.00 0.20028 20200.00 19000.00 0.00 0.20209 20400.00 19000.00 0.00 0.20292 19800.00 19200.00 0.00 0.20337 20000.00 19200.00 0.00 0.20579 20200.00 19200.00 0.00 0.20734 20400.00 19200.00 0.00 0.20787 19800.00 19400.00 0.00 0.20941 20000.00 19400.00 0.00 0.21146 20200.00 19400.00 0.00 0.21263 20400.00 19400.00 0.00 0.21278 19800.00 19600.00 0.00 0.21482 20000.00 19600.00 0.00 0.21637 20200.00 19600.00 0.00 0.21709 19800.00 19800.00 0.00 0.21847 20000.00 19800.00 0.00 0.21951 20200.00 19800.00 0.00 0.21978 19800.00 20000.00 0.00 0.22003 20000.00 20000.00 0.00 0.22063 20000.00 20200.00 65.00 0.22064 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 19931.41 20125.85 56.39 0.22084 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs/235.ctf NX, NY, NZ: 360 360 1 MODE : real