CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs/239.mrc Output diagnostic file name Micrographs/239.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 360 35.0 5.0 8000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs/239.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2354.000 7970.000 Mean, RMS : 4445.157 229.2139 TITLE 1: emi2mrc: 239.emi Sun Jan 19 22:24:24 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 21490, Spot 4, Int 55.12%, Obj 88.06%, Dif 73.67% TITLE 3: X -483.765, Y 537.477, Z -23.067, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 121 119 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 8000.00 8000.00 0.00 -0.02627 13600.00 8000.00 0.00 -0.02567 13800.00 8000.00 0.00 -0.02511 14000.00 8000.00 0.00 -0.02462 14200.00 8000.00 0.00 -0.02415 14400.00 8000.00 0.00 -0.02366 14600.00 8000.00 0.00 -0.02308 14800.00 8000.00 0.00 -0.02238 15000.00 8000.00 0.00 -0.02160 15200.00 8000.00 0.00 -0.02076 15400.00 8000.00 0.00 -0.01987 15600.00 8000.00 0.00 -0.01895 15800.00 8000.00 0.00 -0.01801 16000.00 8000.00 0.00 -0.01703 16200.00 8000.00 0.00 -0.01603 16400.00 8000.00 0.00 -0.01496 16600.00 8000.00 0.00 -0.01377 16800.00 8000.00 0.00 -0.01240 17000.00 8000.00 0.00 -0.01086 17200.00 8000.00 0.00 -0.00918 17400.00 8000.00 0.00 -0.00745 17600.00 8000.00 0.00 -0.00577 17800.00 8000.00 0.00 -0.00419 18000.00 8000.00 0.00 -0.00268 18200.00 8000.00 0.00 -0.00122 18400.00 8000.00 0.00 0.00026 18600.00 8000.00 0.00 0.00179 18800.00 8000.00 0.00 0.00338 19000.00 8000.00 0.00 0.00503 19200.00 8000.00 0.00 0.00670 19400.00 8000.00 0.00 0.00841 19600.00 8000.00 0.00 0.01012 19800.00 8000.00 0.00 0.01184 20000.00 8000.00 0.00 0.01356 20200.00 8000.00 0.00 0.01529 20400.00 8000.00 0.00 0.01704 20600.00 8000.00 0.00 0.01882 20800.00 8000.00 0.00 0.02066 21000.00 8000.00 0.00 0.02256 21200.00 8000.00 0.00 0.02453 21400.00 8000.00 0.00 0.02658 21600.00 8000.00 0.00 0.02873 21800.00 8000.00 0.00 0.03095 22000.00 8000.00 0.00 0.03325 22200.00 8000.00 0.00 0.03562 22400.00 8000.00 0.00 0.03806 22600.00 8000.00 0.00 0.04063 22800.00 8000.00 0.00 0.04334 23000.00 8000.00 0.00 0.04613 23200.00 8000.00 0.00 0.04886 23400.00 8000.00 0.00 0.05133 23600.00 8000.00 0.00 0.05330 23800.00 8000.00 0.00 0.05469 24000.00 8000.00 0.00 0.05550 24200.00 8000.00 0.00 0.05585 24400.00 8000.00 0.00 0.05593 24000.00 8200.00 0.00 0.05594 24200.00 8200.00 0.00 0.05631 24400.00 8200.00 0.00 0.05640 24000.00 8400.00 0.00 0.05652 24200.00 8400.00 0.00 0.05692 24400.00 8400.00 0.00 0.05702 24000.00 8600.00 0.00 0.05726 24200.00 8600.00 0.00 0.05768 24400.00 8600.00 0.00 0.05779 24000.00 8800.00 0.00 0.05810 24200.00 8800.00 0.00 0.05853 24400.00 8800.00 0.00 0.05863 24000.00 9000.00 0.00 0.05893 24200.00 9000.00 0.00 0.05935 24400.00 9000.00 0.00 0.05943 24000.00 9200.00 0.00 0.05973 24200.00 9200.00 0.00 0.06013 24400.00 9200.00 0.00 0.06019 24000.00 9400.00 0.00 0.06049 24200.00 9400.00 0.00 0.06088 24400.00 9400.00 0.00 0.06091 24000.00 9600.00 0.00 0.06125 24200.00 9600.00 0.00 0.06161 24000.00 9800.00 0.00 0.06207 24200.00 9800.00 0.00 0.06240 24000.00 10000.00 0.00 0.06295 24200.00 10000.00 0.00 0.06325 24000.00 10200.00 0.00 0.06381 24200.00 10200.00 0.00 0.06408 24000.00 10400.00 0.00 0.06459 24200.00 10400.00 0.00 0.06484 24000.00 10600.00 0.00 0.06531 24200.00 10600.00 0.00 0.06553 24000.00 10800.00 0.00 0.06600 24200.00 10800.00 0.00 0.06622 24000.00 11000.00 0.00 0.06681 24200.00 11000.00 0.00 0.06703 23800.00 11200.00 0.00 0.06704 24000.00 11200.00 0.00 0.06784 24200.00 11200.00 0.00 0.06805 23800.00 11400.00 0.00 0.06824 24000.00 11400.00 0.00 0.06902 24200.00 11400.00 0.00 0.06923 23800.00 11600.00 0.00 0.06951 24000.00 11600.00 0.00 0.07027 24200.00 11600.00 0.00 0.07046 23800.00 11800.00 0.00 0.07075 24000.00 11800.00 0.00 0.07148 24200.00 11800.00 0.00 0.07165 23800.00 12000.00 0.00 0.07185 24000.00 12000.00 0.00 0.07255 24200.00 12000.00 0.00 0.07270 23800.00 12200.00 0.00 0.07284 24000.00 12200.00 0.00 0.07352 24200.00 12200.00 0.00 0.07366 23800.00 12400.00 0.00 0.07385 24000.00 12400.00 0.00 0.07452 24200.00 12400.00 0.00 0.07468 23800.00 12600.00 0.00 0.07495 24000.00 12600.00 0.00 0.07564 24200.00 12600.00 0.00 0.07582 23800.00 12800.00 0.00 0.07616 24000.00 12800.00 0.00 0.07687 24200.00 12800.00 0.00 0.07708 23800.00 13000.00 0.00 0.07746 24000.00 13000.00 0.00 0.07821 24200.00 13000.00 0.00 0.07845 23800.00 13200.00 0.00 0.07881 24000.00 13200.00 0.00 0.07959 24200.00 13200.00 0.00 0.07985 23800.00 13400.00 0.00 0.08013 24000.00 13400.00 0.00 0.08094 24200.00 13400.00 0.00 0.08121 23800.00 13600.00 0.00 0.08148 24000.00 13600.00 0.00 0.08230 24200.00 13600.00 0.00 0.08256 23800.00 13800.00 0.00 0.08288 24000.00 13800.00 0.00 0.08369 24200.00 13800.00 0.00 0.08393 23800.00 14000.00 0.00 0.08432 24000.00 14000.00 0.00 0.08511 24200.00 14000.00 0.00 0.08532 23800.00 14200.00 0.00 0.08580 24000.00 14200.00 0.00 0.08657 24200.00 14200.00 0.00 0.08675 23800.00 14400.00 0.00 0.08734 24000.00 14400.00 0.00 0.08809 24200.00 14400.00 0.00 0.08824 23800.00 14600.00 0.00 0.08890 24000.00 14600.00 0.00 0.08962 24200.00 14600.00 0.00 0.08974 23800.00 14800.00 0.00 0.09048 24000.00 14800.00 0.00 0.09117 24200.00 14800.00 0.00 0.09125 23800.00 15000.00 0.00 0.09210 24000.00 15000.00 0.00 0.09276 24200.00 15000.00 0.00 0.09280 23800.00 15200.00 0.00 0.09372 24000.00 15200.00 0.00 0.09435 24200.00 15200.00 0.00 0.09436 23800.00 15400.00 0.00 0.09532 24000.00 15400.00 0.00 0.09592 23800.00 15600.00 0.00 0.09694 24000.00 15600.00 0.00 0.09754 23800.00 15800.00 0.00 0.09862 24000.00 15800.00 0.00 0.09921 23800.00 16000.00 0.00 0.10043 24000.00 16000.00 0.00 0.10102 23600.00 16200.00 0.00 0.10105 23800.00 16200.00 0.00 0.10246 24000.00 16200.00 0.00 0.10307 23600.00 16400.00 0.00 0.10325 23800.00 16400.00 0.00 0.10468 24000.00 16400.00 0.00 0.10531 23600.00 16600.00 0.00 0.10553 23800.00 16600.00 0.00 0.10700 24000.00 16600.00 0.00 0.10764 23600.00 16800.00 0.00 0.10786 23800.00 16800.00 0.00 0.10936 24000.00 16800.00 0.00 0.10999 23600.00 17000.00 0.00 0.11020 23800.00 17000.00 0.00 0.11170 24000.00 17000.00 0.00 0.11231 23600.00 17200.00 0.00 0.11250 23800.00 17200.00 0.00 0.11397 24000.00 17200.00 0.00 0.11455 23600.00 17400.00 0.00 0.11485 23800.00 17400.00 0.00 0.11628 24000.00 17400.00 0.00 0.11682 23600.00 17600.00 0.00 0.11729 23800.00 17600.00 0.00 0.11869 24000.00 17600.00 0.00 0.11919 23600.00 17800.00 0.00 0.11976 23800.00 17800.00 0.00 0.12113 24000.00 17800.00 0.00 0.12159 23600.00 18000.00 0.00 0.12223 23800.00 18000.00 0.00 0.12358 24000.00 18000.00 0.00 0.12400 23600.00 18200.00 0.00 0.12471 23800.00 18200.00 0.00 0.12604 24000.00 18200.00 0.00 0.12643 23600.00 18400.00 0.00 0.12717 23800.00 18400.00 0.00 0.12849 24000.00 18400.00 0.00 0.12886 23600.00 18600.00 0.00 0.12968 23800.00 18600.00 0.00 0.13100 24000.00 18600.00 0.00 0.13136 23600.00 18800.00 0.00 0.13236 23800.00 18800.00 0.00 0.13368 24000.00 18800.00 0.00 0.13403 23600.00 19000.00 0.00 0.13513 23800.00 19000.00 0.00 0.13646 24000.00 19000.00 0.00 0.13678 23600.00 19200.00 0.00 0.13789 23800.00 19200.00 0.00 0.13921 24000.00 19200.00 0.00 0.13951 23600.00 19400.00 0.00 0.14069 23800.00 19400.00 0.00 0.14200 24000.00 19400.00 0.00 0.14225 23600.00 19600.00 0.00 0.14351 23800.00 19600.00 0.00 0.14480 24000.00 19600.00 0.00 0.14499 23600.00 19800.00 0.00 0.14639 23800.00 19800.00 0.00 0.14763 24000.00 19800.00 0.00 0.14775 23600.00 20000.00 0.00 0.14948 23800.00 20000.00 0.00 0.15067 24000.00 20000.00 0.00 0.15070 23600.00 20200.00 0.00 0.15276 23800.00 20200.00 0.00 0.15388 23600.00 20400.00 0.00 0.15603 23800.00 20400.00 0.00 0.15707 23600.00 20600.00 0.00 0.15929 23800.00 20600.00 0.00 0.16024 23600.00 20800.00 0.00 0.16260 23800.00 20800.00 0.00 0.16346 23400.00 21000.00 0.00 0.16372 23600.00 21000.00 0.00 0.16603 23800.00 21000.00 0.00 0.16680 23400.00 21200.00 0.00 0.16755 23600.00 21200.00 0.00 0.16981 23800.00 21200.00 0.00 0.17046 23400.00 21400.00 0.00 0.17180 23600.00 21400.00 0.00 0.17398 23800.00 21400.00 0.00 0.17450 23400.00 21600.00 0.00 0.17615 23600.00 21600.00 0.00 0.17823 23800.00 21600.00 0.00 0.17859 23400.00 21800.00 0.00 0.18036 23600.00 21800.00 0.00 0.18232 23800.00 21800.00 0.00 0.18249 23400.00 22000.00 0.00 0.18441 23600.00 22000.00 0.00 0.18625 23400.00 22200.00 0.00 0.18844 23600.00 22200.00 0.00 0.19014 23400.00 22400.00 0.00 0.19288 23600.00 22400.00 0.00 0.19438 23200.00 22600.00 0.00 0.19476 23400.00 22600.00 0.00 0.19814 23600.00 22600.00 0.00 0.19932 23200.00 22800.00 0.00 0.20076 23400.00 22800.00 0.00 0.20380 23600.00 22800.00 0.00 0.20447 23200.00 23000.00 0.00 0.20627 23400.00 23000.00 0.00 0.20878 23200.00 23200.00 0.00 0.21026 23400.00 23200.00 0.00 0.21204 23400.00 23400.00 0.00 0.21256 23200.00 23400.00 45.00 0.21259 23200.00 23400.00 50.00 0.21261 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 23286.98 23433.13 54.73 0.21299 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs/239.ctf NX, NY, NZ: 360 360 1 MODE : real