CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs/299.mrc Output diagnostic file name Micrographs/299.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 360 35.0 5.0 8000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs/299.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2324.000 8062.000 Mean, RMS : 4446.043 225.8198 TITLE 1: emi2mrc: 299.emi Sun Jan 19 23:27:00 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 27890, Spot 4, Int 55.12%, Obj 88.05%, Dif 73.67% TITLE 3: X -490.611, Y 542.141, Z -22.333, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 121 120 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 8000.00 8000.00 0.00 -0.03042 8600.00 8000.00 0.00 -0.03032 8800.00 8000.00 0.00 -0.03025 13800.00 8000.00 0.00 -0.02996 14000.00 8000.00 0.00 -0.02956 14200.00 8000.00 0.00 -0.02911 14400.00 8000.00 0.00 -0.02859 14600.00 8000.00 0.00 -0.02795 14800.00 8000.00 0.00 -0.02717 15000.00 8000.00 0.00 -0.02624 15200.00 8000.00 0.00 -0.02522 15400.00 8000.00 0.00 -0.02418 15600.00 8000.00 0.00 -0.02321 15800.00 8000.00 0.00 -0.02238 16000.00 8000.00 0.00 -0.02167 16200.00 8000.00 0.00 -0.02103 16400.00 8000.00 0.00 -0.02039 16600.00 8000.00 0.00 -0.01965 16800.00 8000.00 0.00 -0.01878 17000.00 8000.00 0.00 -0.01782 17200.00 8000.00 0.00 -0.01680 17400.00 8000.00 0.00 -0.01577 17600.00 8000.00 0.00 -0.01469 17800.00 8000.00 0.00 -0.01351 18000.00 8000.00 0.00 -0.01214 18200.00 8000.00 0.00 -0.01059 18400.00 8000.00 0.00 -0.00892 18600.00 8000.00 0.00 -0.00723 18800.00 8000.00 0.00 -0.00561 19000.00 8000.00 0.00 -0.00407 19200.00 8000.00 0.00 -0.00255 19400.00 8000.00 0.00 -0.00096 19600.00 8000.00 0.00 0.00073 19800.00 8000.00 0.00 0.00247 20000.00 8000.00 0.00 0.00419 20200.00 8000.00 0.00 0.00580 20400.00 8000.00 0.00 0.00731 20600.00 8000.00 0.00 0.00877 20800.00 8000.00 0.00 0.01027 21000.00 8000.00 0.00 0.01188 21200.00 8000.00 0.00 0.01362 21400.00 8000.00 0.00 0.01551 21600.00 8000.00 0.00 0.01752 21800.00 8000.00 0.00 0.01964 22000.00 8000.00 0.00 0.02190 22200.00 8000.00 0.00 0.02429 22400.00 8000.00 0.00 0.02680 22600.00 8000.00 0.00 0.02941 22800.00 8000.00 0.00 0.03205 23000.00 8000.00 0.00 0.03467 23200.00 8000.00 0.00 0.03721 23400.00 8000.00 0.00 0.03962 23600.00 8000.00 0.00 0.04180 23800.00 8000.00 0.00 0.04371 24000.00 8000.00 0.00 0.04526 24200.00 8000.00 0.00 0.04638 24400.00 8000.00 0.00 0.04710 24600.00 8000.00 0.00 0.04747 24800.00 8000.00 0.00 0.04756 24600.00 8200.00 0.00 0.04788 24800.00 8200.00 0.00 0.04798 24600.00 8400.00 0.00 0.04831 24800.00 8400.00 0.00 0.04842 24600.00 8600.00 0.00 0.04884 24800.00 8600.00 0.00 0.04897 24400.00 8800.00 0.00 0.04905 24600.00 8800.00 0.00 0.04950 24800.00 8800.00 0.00 0.04966 24400.00 9000.00 0.00 0.04978 24600.00 9000.00 0.00 0.05026 24800.00 9000.00 0.00 0.05044 24400.00 9200.00 0.00 0.05057 24600.00 9200.00 0.00 0.05108 24800.00 9200.00 0.00 0.05127 24400.00 9400.00 0.00 0.05134 24600.00 9400.00 0.00 0.05187 24800.00 9400.00 0.00 0.05206 24400.00 9600.00 0.00 0.05209 24600.00 9600.00 0.00 0.05262 24800.00 9600.00 0.00 0.05280 24400.00 9800.00 0.00 0.05286 24600.00 9800.00 0.00 0.05338 24800.00 9800.00 0.00 0.05353 24400.00 10000.00 0.00 0.05372 24600.00 10000.00 0.00 0.05421 24800.00 10000.00 0.00 0.05432 24400.00 10200.00 0.00 0.05464 24600.00 10200.00 0.00 0.05508 24800.00 10200.00 0.00 0.05514 24400.00 10400.00 0.00 0.05558 24600.00 10400.00 0.00 0.05598 24800.00 10400.00 0.00 0.05599 24400.00 10600.00 0.00 0.05650 24600.00 10600.00 0.00 0.05685 24400.00 10800.00 0.00 0.05735 24600.00 10800.00 0.00 0.05766 24400.00 11000.00 0.00 0.05817 24600.00 11000.00 0.00 0.05845 24400.00 11200.00 0.00 0.05902 24600.00 11200.00 0.00 0.05927 24400.00 11400.00 0.00 0.05990 24600.00 11400.00 0.00 0.06013 24400.00 11600.00 0.00 0.06080 24600.00 11600.00 0.00 0.06102 24200.00 11800.00 0.00 0.06107 24400.00 11800.00 0.00 0.06174 24600.00 11800.00 0.00 0.06195 24200.00 12000.00 0.00 0.06202 24400.00 12000.00 0.00 0.06267 24600.00 12000.00 0.00 0.06287 24200.00 12200.00 0.00 0.06296 24400.00 12200.00 0.00 0.06360 24600.00 12200.00 0.00 0.06379 24200.00 12400.00 0.00 0.06399 24400.00 12400.00 0.00 0.06462 24600.00 12400.00 0.00 0.06480 24200.00 12600.00 0.00 0.06511 24400.00 12600.00 0.00 0.06572 24600.00 12600.00 0.00 0.06589 24200.00 12800.00 0.00 0.06629 24400.00 12800.00 0.00 0.06689 24600.00 12800.00 0.00 0.06705 24200.00 13000.00 0.00 0.06754 24400.00 13000.00 0.00 0.06813 24600.00 13000.00 0.00 0.06829 24200.00 13200.00 0.00 0.06886 24400.00 13200.00 0.00 0.06944 24600.00 13200.00 0.00 0.06959 24200.00 13400.00 0.00 0.07022 24400.00 13400.00 0.00 0.07078 24600.00 13400.00 0.00 0.07092 24200.00 13600.00 0.00 0.07166 24400.00 13600.00 0.00 0.07221 24600.00 13600.00 0.00 0.07234 24200.00 13800.00 0.00 0.07322 24400.00 13800.00 0.00 0.07375 24600.00 13800.00 0.00 0.07386 24200.00 14000.00 0.00 0.07480 24400.00 14000.00 0.00 0.07531 24600.00 14000.00 0.00 0.07542 24200.00 14200.00 0.00 0.07636 24400.00 14200.00 0.00 0.07685 24600.00 14200.00 0.00 0.07695 24200.00 14400.00 0.00 0.07786 24400.00 14400.00 0.00 0.07834 24600.00 14400.00 0.00 0.07843 24200.00 14600.00 0.00 0.07929 24400.00 14600.00 0.00 0.07976 24600.00 14600.00 0.00 0.07984 24200.00 14800.00 0.00 0.08072 24400.00 14800.00 0.00 0.08119 24600.00 14800.00 0.00 0.08128 24200.00 15000.00 0.00 0.08227 24400.00 15000.00 0.00 0.08275 24600.00 15000.00 0.00 0.08286 24000.00 15200.00 0.00 0.08292 24200.00 15200.00 0.00 0.08395 24400.00 15200.00 0.00 0.08445 24600.00 15200.00 0.00 0.08458 24000.00 15400.00 0.00 0.08467 24200.00 15400.00 0.00 0.08572 24400.00 15400.00 0.00 0.08625 24600.00 15400.00 0.00 0.08640 24000.00 15600.00 0.00 0.08646 24200.00 15600.00 0.00 0.08753 24400.00 15600.00 0.00 0.08808 24600.00 15600.00 0.00 0.08825 24200.00 15800.00 0.00 0.08932 24400.00 15800.00 0.00 0.08989 24600.00 15800.00 0.00 0.09008 24200.00 16000.00 0.00 0.09108 24400.00 16000.00 0.00 0.09168 24600.00 16000.00 0.00 0.09189 24200.00 16200.00 0.00 0.09293 24400.00 16200.00 0.00 0.09356 24600.00 16200.00 0.00 0.09377 24200.00 16400.00 0.00 0.09491 24400.00 16400.00 0.00 0.09555 24600.00 16400.00 0.00 0.09575 24200.00 16600.00 0.00 0.09695 24400.00 16600.00 0.00 0.09759 24600.00 16600.00 0.00 0.09776 24000.00 16800.00 0.00 0.09783 24200.00 16800.00 0.00 0.09904 24400.00 16800.00 0.00 0.09965 24600.00 16800.00 0.00 0.09979 24000.00 17000.00 0.00 0.09992 24200.00 17000.00 0.00 0.10112 24400.00 17000.00 0.00 0.10170 24600.00 17000.00 0.00 0.10179 24000.00 17200.00 0.00 0.10199 24200.00 17200.00 0.00 0.10316 24400.00 17200.00 0.00 0.10371 24600.00 17200.00 0.00 0.10376 24000.00 17400.00 0.00 0.10415 24200.00 17400.00 0.00 0.10532 24400.00 17400.00 0.00 0.10584 24600.00 17400.00 0.00 0.10584 24000.00 17600.00 0.00 0.10654 24200.00 17600.00 0.00 0.10769 24400.00 17600.00 0.00 0.10818 24000.00 17800.00 0.00 0.10909 24200.00 17800.00 0.00 0.11022 24400.00 17800.00 0.00 0.11068 24000.00 18000.00 0.00 0.11173 24200.00 18000.00 0.00 0.11285 24400.00 18000.00 0.00 0.11327 24000.00 18200.00 0.00 0.11440 24200.00 18200.00 0.00 0.11548 24400.00 18200.00 0.00 0.11588 24000.00 18400.00 0.00 0.11695 24200.00 18400.00 0.00 0.11802 24400.00 18400.00 0.00 0.11838 24000.00 18600.00 0.00 0.11946 24200.00 18600.00 0.00 0.12050 24400.00 18600.00 0.00 0.12084 24000.00 18800.00 0.00 0.12207 24200.00 18800.00 0.00 0.12307 24400.00 18800.00 0.00 0.12337 24000.00 19000.00 0.00 0.12477 24200.00 19000.00 0.00 0.12573 24400.00 19000.00 0.00 0.12599 24000.00 19200.00 0.00 0.12752 24200.00 19200.00 0.00 0.12844 24400.00 19200.00 0.00 0.12865 24000.00 19400.00 0.00 0.13030 24200.00 19400.00 0.00 0.13118 24400.00 19400.00 0.00 0.13134 24000.00 19600.00 0.00 0.13301 24200.00 19600.00 0.00 0.13385 24400.00 19600.00 0.00 0.13396 23800.00 19800.00 0.00 0.13397 24000.00 19800.00 0.00 0.13561 24200.00 19800.00 0.00 0.13640 24400.00 19800.00 0.00 0.13645 23800.00 20000.00 0.00 0.13666 24000.00 20000.00 0.00 0.13826 24200.00 20000.00 0.00 0.13900 23800.00 20200.00 0.00 0.13947 24000.00 20200.00 0.00 0.14103 24200.00 20200.00 0.00 0.14172 23800.00 20400.00 0.00 0.14232 24000.00 20400.00 0.00 0.14385 24200.00 20400.00 0.00 0.14449 23800.00 20600.00 0.00 0.14522 24000.00 20600.00 0.00 0.14673 24200.00 20600.00 0.00 0.14733 23800.00 20800.00 0.00 0.14818 24000.00 20800.00 0.00 0.14967 24200.00 20800.00 0.00 0.15025 23800.00 21000.00 0.00 0.15117 24000.00 21000.00 0.00 0.15265 24200.00 21000.00 0.00 0.15318 23800.00 21200.00 0.00 0.15435 24000.00 21200.00 0.00 0.15579 24200.00 21200.00 0.00 0.15626 23800.00 21400.00 0.00 0.15787 24000.00 21400.00 0.00 0.15925 24200.00 21400.00 0.00 0.15963 23800.00 21600.00 0.00 0.16159 24000.00 21600.00 0.00 0.16288 24200.00 21600.00 0.00 0.16314 23800.00 21800.00 0.00 0.16533 24000.00 21800.00 0.00 0.16651 24200.00 21800.00 0.00 0.16664 23600.00 22000.00 0.00 0.16689 23800.00 22000.00 0.00 0.16903 24000.00 22000.00 0.00 0.17010 24200.00 22000.00 0.00 0.17010 23600.00 22200.00 0.00 0.17054 23800.00 22200.00 0.00 0.17262 24000.00 22200.00 0.00 0.17359 23600.00 22400.00 0.00 0.17433 23800.00 22400.00 0.00 0.17635 24000.00 22400.00 0.00 0.17720 23600.00 22600.00 0.00 0.17876 23800.00 22600.00 0.00 0.18067 24000.00 22600.00 0.00 0.18134 23600.00 22800.00 0.00 0.18388 23800.00 22800.00 0.00 0.18557 24000.00 22800.00 0.00 0.18597 23400.00 23000.00 0.00 0.18646 23600.00 23000.00 0.00 0.18931 23800.00 23000.00 0.00 0.19066 24000.00 23000.00 0.00 0.19068 23400.00 23200.00 0.00 0.19205 23600.00 23200.00 0.00 0.19449 23800.00 23200.00 0.00 0.19533 23400.00 23400.00 0.00 0.19655 23600.00 23400.00 0.00 0.19839 23800.00 23400.00 0.00 0.19861 23400.00 23600.00 0.00 0.19885 23600.00 23600.00 0.00 0.20002 23400.00 23800.00 35.00 0.20002 23600.00 23800.00 35.00 0.20003 23400.00 23800.00 40.00 0.20009 23600.00 23800.00 40.00 0.20009 23400.00 23800.00 45.00 0.20011 23600.00 23800.00 45.00 0.20013 23600.00 23800.00 50.00 0.20015 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 23518.19 23744.54 46.26 0.20044 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs/299.ctf NX, NY, NZ: 360 360 1 MODE : real