CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs/339.mrc Output diagnostic file name Micrographs/339.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 360 35.0 5.0 8000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs/339.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2290.000 7694.000 Mean, RMS : 4412.850 226.4415 TITLE 1: emi2mrc: 339.emi Mon Jan 20 00:38:42 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 29040, Spot 4, Int 55.12%, Obj 88.07%, Dif 73.67% TITLE 3: X -492.071, Y 544.145, Z -23.326, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 121 120 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 8000.00 8000.00 0.00 -0.03703 17600.00 8000.00 0.00 -0.03698 17800.00 8000.00 0.00 -0.03588 18000.00 8000.00 0.00 -0.03469 18200.00 8000.00 0.00 -0.03344 18400.00 8000.00 0.00 -0.03216 18600.00 8000.00 0.00 -0.03087 18800.00 8000.00 0.00 -0.02963 19000.00 8000.00 0.00 -0.02846 19200.00 8000.00 0.00 -0.02735 19400.00 8000.00 0.00 -0.02628 19600.00 8000.00 0.00 -0.02517 19800.00 8000.00 0.00 -0.02399 20000.00 8000.00 0.00 -0.02275 20200.00 8000.00 0.00 -0.02149 20400.00 8000.00 0.00 -0.02026 20600.00 8000.00 0.00 -0.01911 20800.00 8000.00 0.00 -0.01799 21000.00 8000.00 0.00 -0.01681 21200.00 8000.00 0.00 -0.01550 21400.00 8000.00 0.00 -0.01403 21600.00 8000.00 0.00 -0.01241 21800.00 8000.00 0.00 -0.01070 22000.00 8000.00 0.00 -0.00895 22200.00 8000.00 0.00 -0.00718 22400.00 8000.00 0.00 -0.00537 22600.00 8000.00 0.00 -0.00355 22800.00 8000.00 0.00 -0.00176 23000.00 8000.00 0.00 -0.00006 23200.00 8000.00 0.00 0.00151 23400.00 8000.00 0.00 0.00298 23600.00 8000.00 0.00 0.00446 23800.00 8000.00 0.00 0.00609 24000.00 8000.00 0.00 0.00799 24200.00 8000.00 0.00 0.01014 24400.00 8000.00 0.00 0.01246 24600.00 8000.00 0.00 0.01482 24800.00 8000.00 0.00 0.01711 25000.00 8000.00 0.00 0.01932 25200.00 8000.00 0.00 0.02153 25400.00 8000.00 0.00 0.02376 25600.00 8000.00 0.00 0.02600 25800.00 8000.00 0.00 0.02815 26000.00 8000.00 0.00 0.03002 26200.00 8000.00 0.00 0.03147 26400.00 8000.00 0.00 0.03246 26600.00 8000.00 0.00 0.03302 26800.00 8000.00 0.00 0.03319 26600.00 8200.00 0.00 0.03322 26800.00 8200.00 0.00 0.03339 26600.00 8400.00 0.00 0.03351 26800.00 8400.00 0.00 0.03367 26600.00 8600.00 0.00 0.03391 26800.00 8600.00 0.00 0.03407 26600.00 8800.00 0.00 0.03437 26800.00 8800.00 0.00 0.03454 26600.00 9000.00 0.00 0.03480 26800.00 9000.00 0.00 0.03498 26600.00 9200.00 0.00 0.03516 26800.00 9200.00 0.00 0.03535 26600.00 9400.00 0.00 0.03542 26800.00 9400.00 0.00 0.03562 26600.00 9600.00 0.00 0.03566 26800.00 9600.00 0.00 0.03586 26600.00 9800.00 0.00 0.03596 26800.00 9800.00 0.00 0.03616 26600.00 10000.00 0.00 0.03638 26800.00 10000.00 0.00 0.03658 26600.00 10200.00 0.00 0.03690 26800.00 10200.00 0.00 0.03707 26600.00 10400.00 0.00 0.03744 26800.00 10400.00 0.00 0.03759 26600.00 10600.00 0.00 0.03795 26800.00 10600.00 0.00 0.03807 26600.00 10800.00 0.00 0.03837 26800.00 10800.00 0.00 0.03846 26600.00 11000.00 0.00 0.03874 26800.00 11000.00 0.00 0.03881 26600.00 11200.00 0.00 0.03912 26800.00 11200.00 0.00 0.03918 26600.00 11400.00 0.00 0.03955 26800.00 11400.00 0.00 0.03961 26400.00 11600.00 0.00 0.03961 26600.00 11600.00 0.00 0.04006 26800.00 11600.00 0.00 0.04013 26400.00 11800.00 0.00 0.04022 26600.00 11800.00 0.00 0.04068 26800.00 11800.00 0.00 0.04078 26400.00 12000.00 0.00 0.04093 26600.00 12000.00 0.00 0.04141 26800.00 12000.00 0.00 0.04154 26400.00 12200.00 0.00 0.04174 26600.00 12200.00 0.00 0.04224 26800.00 12200.00 0.00 0.04239 26400.00 12400.00 0.00 0.04267 26600.00 12400.00 0.00 0.04318 26800.00 12400.00 0.00 0.04334 26400.00 12600.00 0.00 0.04368 26600.00 12600.00 0.00 0.04421 26800.00 12600.00 0.00 0.04437 26400.00 12800.00 0.00 0.04476 26600.00 12800.00 0.00 0.04528 26800.00 12800.00 0.00 0.04543 26400.00 13000.00 0.00 0.04588 26600.00 13000.00 0.00 0.04640 26800.00 13000.00 0.00 0.04653 26400.00 13200.00 0.00 0.04703 26600.00 13200.00 0.00 0.04753 26800.00 13200.00 0.00 0.04765 26400.00 13400.00 0.00 0.04817 26600.00 13400.00 0.00 0.04866 26800.00 13400.00 0.00 0.04876 26400.00 13600.00 0.00 0.04931 26600.00 13600.00 0.00 0.04978 26800.00 13600.00 0.00 0.04987 26400.00 13800.00 0.00 0.05042 26600.00 13800.00 0.00 0.05088 26800.00 13800.00 0.00 0.05096 26400.00 14000.00 0.00 0.05145 26600.00 14000.00 0.00 0.05191 26800.00 14000.00 0.00 0.05198 26400.00 14200.00 0.00 0.05244 26600.00 14200.00 0.00 0.05290 26800.00 14200.00 0.00 0.05297 26400.00 14400.00 0.00 0.05345 26600.00 14400.00 0.00 0.05391 26800.00 14400.00 0.00 0.05398 26400.00 14600.00 0.00 0.05451 26600.00 14600.00 0.00 0.05497 26800.00 14600.00 0.00 0.05504 26400.00 14800.00 0.00 0.05568 26600.00 14800.00 0.00 0.05614 26800.00 14800.00 0.00 0.05619 26400.00 15000.00 0.00 0.05696 26600.00 15000.00 0.00 0.05741 26800.00 15000.00 0.00 0.05744 26400.00 15200.00 0.00 0.05826 26600.00 15200.00 0.00 0.05868 26400.00 15400.00 0.00 0.05947 26600.00 15400.00 0.00 0.05986 26400.00 15600.00 0.00 0.06061 26600.00 15600.00 0.00 0.06096 26400.00 15800.00 0.00 0.06171 26600.00 15800.00 0.00 0.06203 26400.00 16000.00 0.00 0.06284 26600.00 16000.00 0.00 0.06314 26200.00 16200.00 0.00 0.06325 26400.00 16200.00 0.00 0.06409 26600.00 16200.00 0.00 0.06438 26200.00 16400.00 0.00 0.06462 26400.00 16400.00 0.00 0.06545 26600.00 16400.00 0.00 0.06573 26200.00 16600.00 0.00 0.06602 26400.00 16600.00 0.00 0.06684 26600.00 16600.00 0.00 0.06711 26200.00 16800.00 0.00 0.06741 26400.00 16800.00 0.00 0.06823 26600.00 16800.00 0.00 0.06849 26200.00 17000.00 0.00 0.06880 26400.00 17000.00 0.00 0.06962 26600.00 17000.00 0.00 0.06988 26200.00 17200.00 0.00 0.07024 26400.00 17200.00 0.00 0.07105 26600.00 17200.00 0.00 0.07131 26200.00 17400.00 0.00 0.07181 26400.00 17400.00 0.00 0.07262 26600.00 17400.00 0.00 0.07288 26200.00 17600.00 0.00 0.07354 26400.00 17600.00 0.00 0.07436 26600.00 17600.00 0.00 0.07462 26200.00 17800.00 0.00 0.07538 26400.00 17800.00 0.00 0.07621 26600.00 17800.00 0.00 0.07647 26200.00 18000.00 0.00 0.07728 26400.00 18000.00 0.00 0.07812 26600.00 18000.00 0.00 0.07839 26200.00 18200.00 0.00 0.07921 26400.00 18200.00 0.00 0.08006 26600.00 18200.00 0.00 0.08034 26200.00 18400.00 0.00 0.08116 26400.00 18400.00 0.00 0.08202 26600.00 18400.00 0.00 0.08231 26200.00 18600.00 0.00 0.08319 26400.00 18600.00 0.00 0.08406 26600.00 18600.00 0.00 0.08436 26200.00 18800.00 0.00 0.08535 26400.00 18800.00 0.00 0.08624 26600.00 18800.00 0.00 0.08654 26200.00 19000.00 0.00 0.08758 26400.00 19000.00 0.00 0.08848 26600.00 19000.00 0.00 0.08878 26200.00 19200.00 0.00 0.08980 26400.00 19200.00 0.00 0.09070 26600.00 19200.00 0.00 0.09101 26200.00 19400.00 0.00 0.09199 26400.00 19400.00 0.00 0.09290 26600.00 19400.00 0.00 0.09319 26200.00 19600.00 0.00 0.09414 26400.00 19600.00 0.00 0.09503 26600.00 19600.00 0.00 0.09530 26200.00 19800.00 0.00 0.09629 26400.00 19800.00 0.00 0.09716 26600.00 19800.00 0.00 0.09739 26200.00 20000.00 0.00 0.09854 26400.00 20000.00 0.00 0.09939 26600.00 20000.00 0.00 0.09959 26200.00 20200.00 0.00 0.10089 26400.00 20200.00 0.00 0.10172 26600.00 20200.00 0.00 0.10190 26200.00 20400.00 0.00 0.10324 26400.00 20400.00 0.00 0.10405 26600.00 20400.00 0.00 0.10420 26200.00 20600.00 0.00 0.10556 26400.00 20600.00 0.00 0.10636 26600.00 20600.00 0.00 0.10647 26200.00 20800.00 0.00 0.10785 26400.00 20800.00 0.00 0.10862 26600.00 20800.00 0.00 0.10871 26200.00 21000.00 0.00 0.11012 26400.00 21000.00 0.00 0.11088 26600.00 21000.00 0.00 0.11094 26200.00 21200.00 0.00 0.11251 26400.00 21200.00 0.00 0.11325 26600.00 21200.00 0.00 0.11330 26000.00 21400.00 0.00 0.11350 26200.00 21400.00 0.00 0.11509 26400.00 21400.00 0.00 0.11582 26600.00 21400.00 0.00 0.11582 26000.00 21600.00 0.00 0.11613 26200.00 21600.00 0.00 0.11772 26400.00 21600.00 0.00 0.11841 26000.00 21800.00 0.00 0.11871 26200.00 21800.00 0.00 0.12028 26400.00 21800.00 0.00 0.12093 26000.00 22000.00 0.00 0.12124 26200.00 22000.00 0.00 0.12280 26400.00 22000.00 0.00 0.12340 26000.00 22200.00 0.00 0.12374 26200.00 22200.00 0.00 0.12527 26400.00 22200.00 0.00 0.12582 26000.00 22400.00 0.00 0.12632 26200.00 22400.00 0.00 0.12782 26400.00 22400.00 0.00 0.12832 26000.00 22600.00 0.00 0.12918 26200.00 22600.00 0.00 0.13064 26400.00 22600.00 0.00 0.13108 26000.00 22800.00 0.00 0.13226 26200.00 22800.00 0.00 0.13369 26400.00 22800.00 0.00 0.13404 26000.00 23000.00 0.00 0.13542 26200.00 23000.00 0.00 0.13678 26400.00 23000.00 0.00 0.13705 26000.00 23200.00 0.00 0.13861 26200.00 23200.00 0.00 0.13991 26400.00 23200.00 0.00 0.14008 26000.00 23400.00 0.00 0.14184 26200.00 23400.00 0.00 0.14306 26400.00 23400.00 0.00 0.14313 26000.00 23600.00 0.00 0.14515 26200.00 23600.00 0.00 0.14629 25800.00 23800.00 0.00 0.14632 26000.00 23800.00 0.00 0.14873 26200.00 23800.00 0.00 0.14977 25800.00 24000.00 0.00 0.15020 26000.00 24000.00 0.00 0.15255 26200.00 24000.00 0.00 0.15347 25800.00 24200.00 0.00 0.15405 26000.00 24200.00 0.00 0.15633 26200.00 24200.00 0.00 0.15711 25800.00 24400.00 0.00 0.15777 26000.00 24400.00 0.00 0.15996 26200.00 24400.00 0.00 0.16059 25800.00 24600.00 0.00 0.16142 26000.00 24600.00 0.00 0.16351 26200.00 24600.00 0.00 0.16396 25800.00 24800.00 0.00 0.16510 26000.00 24800.00 0.00 0.16708 26200.00 24800.00 0.00 0.16735 25800.00 25000.00 0.00 0.16924 26000.00 25000.00 0.00 0.17106 26200.00 25000.00 0.00 0.17109 25800.00 25200.00 0.00 0.17400 26000.00 25200.00 0.00 0.17556 25600.00 25400.00 0.00 0.17584 25800.00 25400.00 0.00 0.17872 26000.00 25400.00 0.00 0.17988 25600.00 25600.00 0.00 0.17996 25800.00 25600.00 0.00 0.18243 26000.00 25600.00 0.00 0.18306 25800.00 25800.00 0.00 0.18437 25800.00 26000.00 30.00 0.18439 25800.00 26000.00 35.00 0.18448 25800.00 26000.00 40.00 0.18455 25800.00 26000.00 45.00 0.18461 25800.00 26000.00 50.00 0.18465 25800.00 26000.00 55.00 0.18466 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 25784.26 25930.88 55.00 0.18484 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs/339.ctf NX, NY, NZ: 360 360 1 MODE : real