CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs/400.mrc Output diagnostic file name Micrographs/400.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 360 35.0 5.0 8000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs/400.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2202.000 8892.000 Mean, RMS : 4283.598 223.5259 TITLE 1: emi2mrc: 400.emi Mon Jan 20 10:33:44 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 32320, Spot 4, Int 55.12%, Obj 88.09%, Dif 73.67% TITLE 3: X -514.867, Y 541.880, Z -22.878, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 121 120 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 8000.00 8000.00 0.00 -0.03807 17200.00 8000.00 0.00 -0.03772 17400.00 8000.00 0.00 -0.03686 17600.00 8000.00 0.00 -0.03599 17800.00 8000.00 0.00 -0.03506 18000.00 8000.00 0.00 -0.03405 18200.00 8000.00 0.00 -0.03298 18400.00 8000.00 0.00 -0.03189 18600.00 8000.00 0.00 -0.03082 18800.00 8000.00 0.00 -0.02980 19000.00 8000.00 0.00 -0.02882 19200.00 8000.00 0.00 -0.02782 19400.00 8000.00 0.00 -0.02674 19600.00 8000.00 0.00 -0.02556 19800.00 8000.00 0.00 -0.02429 20000.00 8000.00 0.00 -0.02300 20200.00 8000.00 0.00 -0.02174 20400.00 8000.00 0.00 -0.02053 20600.00 8000.00 0.00 -0.01937 20800.00 8000.00 0.00 -0.01822 21000.00 8000.00 0.00 -0.01704 21200.00 8000.00 0.00 -0.01580 21400.00 8000.00 0.00 -0.01450 21600.00 8000.00 0.00 -0.01315 21800.00 8000.00 0.00 -0.01178 22000.00 8000.00 0.00 -0.01041 22200.00 8000.00 0.00 -0.00902 22400.00 8000.00 0.00 -0.00761 22600.00 8000.00 0.00 -0.00616 22800.00 8000.00 0.00 -0.00462 23000.00 8000.00 0.00 -0.00297 23200.00 8000.00 0.00 -0.00118 23400.00 8000.00 0.00 0.00073 23600.00 8000.00 0.00 0.00277 23800.00 8000.00 0.00 0.00489 24000.00 8000.00 0.00 0.00704 24200.00 8000.00 0.00 0.00920 24400.00 8000.00 0.00 0.01133 24600.00 8000.00 0.00 0.01345 24800.00 8000.00 0.00 0.01559 25000.00 8000.00 0.00 0.01782 25200.00 8000.00 0.00 0.02021 25400.00 8000.00 0.00 0.02275 25600.00 8000.00 0.00 0.02532 25800.00 8000.00 0.00 0.02777 26000.00 8000.00 0.00 0.02984 26200.00 8000.00 0.00 0.03138 26400.00 8000.00 0.00 0.03233 26600.00 8000.00 0.00 0.03276 26800.00 8000.00 0.00 0.03280 26800.00 8200.00 0.00 0.03280 26600.00 8400.00 0.00 0.03283 26800.00 8400.00 0.00 0.03292 26600.00 8600.00 0.00 0.03306 26800.00 8600.00 0.00 0.03318 26600.00 8800.00 0.00 0.03339 26800.00 8800.00 0.00 0.03355 27000.00 8800.00 0.00 0.03357 26600.00 9000.00 0.00 0.03377 26800.00 9000.00 0.00 0.03396 27000.00 9000.00 0.00 0.03401 27200.00 9000.00 0.00 0.03401 26600.00 9200.00 0.00 0.03415 26800.00 9200.00 0.00 0.03435 27000.00 9200.00 0.00 0.03441 27200.00 9200.00 0.00 0.03442 26600.00 9400.00 0.00 0.03445 26800.00 9400.00 0.00 0.03466 27000.00 9400.00 0.00 0.03472 27200.00 9400.00 0.00 0.03473 26800.00 9600.00 0.00 0.03488 27000.00 9600.00 0.00 0.03495 27200.00 9600.00 0.00 0.03495 26800.00 9800.00 0.00 0.03508 27000.00 9800.00 0.00 0.03515 26800.00 10000.00 0.00 0.03530 27000.00 10000.00 0.00 0.03537 26800.00 10200.00 0.00 0.03557 27000.00 10200.00 0.00 0.03565 26600.00 10400.00 0.00 0.03569 26800.00 10400.00 0.00 0.03593 27000.00 10400.00 0.00 0.03601 26600.00 10600.00 0.00 0.03613 26800.00 10600.00 0.00 0.03638 27000.00 10600.00 0.00 0.03647 26600.00 10800.00 0.00 0.03665 26800.00 10800.00 0.00 0.03692 27000.00 10800.00 0.00 0.03702 27200.00 10800.00 0.00 0.03702 26600.00 11000.00 0.00 0.03724 26800.00 11000.00 0.00 0.03753 27000.00 11000.00 0.00 0.03764 27200.00 11000.00 0.00 0.03766 26600.00 11200.00 0.00 0.03788 26800.00 11200.00 0.00 0.03818 27000.00 11200.00 0.00 0.03831 27200.00 11200.00 0.00 0.03835 26600.00 11400.00 0.00 0.03851 26800.00 11400.00 0.00 0.03882 27000.00 11400.00 0.00 0.03897 27200.00 11400.00 0.00 0.03903 26600.00 11600.00 0.00 0.03909 26800.00 11600.00 0.00 0.03943 27000.00 11600.00 0.00 0.03960 27200.00 11600.00 0.00 0.03968 26800.00 11800.00 0.00 0.04003 27000.00 11800.00 0.00 0.04022 27200.00 11800.00 0.00 0.04033 26800.00 12000.00 0.00 0.04068 27000.00 12000.00 0.00 0.04090 27200.00 12000.00 0.00 0.04102 27400.00 12000.00 0.00 0.04103 26600.00 12200.00 0.00 0.04105 26800.00 12200.00 0.00 0.04145 27000.00 12200.00 0.00 0.04169 27200.00 12200.00 0.00 0.04183 27400.00 12200.00 0.00 0.04184 26600.00 12400.00 0.00 0.04196 26800.00 12400.00 0.00 0.04238 27000.00 12400.00 0.00 0.04264 27200.00 12400.00 0.00 0.04279 27400.00 12400.00 0.00 0.04279 26600.00 12600.00 0.00 0.04298 26800.00 12600.00 0.00 0.04341 27000.00 12600.00 0.00 0.04368 27200.00 12600.00 0.00 0.04383 26600.00 12800.00 0.00 0.04397 26800.00 12800.00 0.00 0.04442 27000.00 12800.00 0.00 0.04469 27200.00 12800.00 0.00 0.04484 26600.00 13000.00 0.00 0.04489 26800.00 13000.00 0.00 0.04534 27000.00 13000.00 0.00 0.04562 27200.00 13000.00 0.00 0.04575 26800.00 13200.00 0.00 0.04618 27000.00 13200.00 0.00 0.04645 27200.00 13200.00 0.00 0.04658 26800.00 13400.00 0.00 0.04702 27000.00 13400.00 0.00 0.04730 27200.00 13400.00 0.00 0.04742 26600.00 13600.00 0.00 0.04752 26800.00 13600.00 0.00 0.04802 27000.00 13600.00 0.00 0.04829 27200.00 13600.00 0.00 0.04840 26600.00 13800.00 0.00 0.04872 26800.00 13800.00 0.00 0.04922 27000.00 13800.00 0.00 0.04949 27200.00 13800.00 0.00 0.04956 26600.00 14000.00 0.00 0.05007 26800.00 14000.00 0.00 0.05055 27000.00 14000.00 0.00 0.05079 27200.00 14000.00 0.00 0.05083 26600.00 14200.00 0.00 0.05142 26800.00 14200.00 0.00 0.05187 27000.00 14200.00 0.00 0.05208 26600.00 14400.00 0.00 0.05266 26800.00 14400.00 0.00 0.05307 27000.00 14400.00 0.00 0.05322 26600.00 14600.00 0.00 0.05371 26800.00 14600.00 0.00 0.05408 27000.00 14600.00 0.00 0.05419 26600.00 14800.00 0.00 0.05465 26800.00 14800.00 0.00 0.05498 27000.00 14800.00 0.00 0.05506 26600.00 15000.00 0.00 0.05564 26800.00 15000.00 0.00 0.05595 27000.00 15000.00 0.00 0.05600 26400.00 15200.00 0.00 0.05605 26600.00 15200.00 0.00 0.05673 26800.00 15200.00 0.00 0.05702 27000.00 15200.00 0.00 0.05708 26400.00 15400.00 0.00 0.05725 26600.00 15400.00 0.00 0.05793 26800.00 15400.00 0.00 0.05823 27000.00 15400.00 0.00 0.05829 26400.00 15600.00 0.00 0.05852 26600.00 15600.00 0.00 0.05921 26800.00 15600.00 0.00 0.05953 27000.00 15600.00 0.00 0.05961 26400.00 15800.00 0.00 0.05981 26600.00 15800.00 0.00 0.06051 26800.00 15800.00 0.00 0.06085 27000.00 15800.00 0.00 0.06095 26400.00 16000.00 0.00 0.06110 26600.00 16000.00 0.00 0.06182 26800.00 16000.00 0.00 0.06217 27000.00 16000.00 0.00 0.06227 26400.00 16200.00 0.00 0.06246 26600.00 16200.00 0.00 0.06320 26800.00 16200.00 0.00 0.06355 27000.00 16200.00 0.00 0.06365 26400.00 16400.00 0.00 0.06395 26600.00 16400.00 0.00 0.06470 26800.00 16400.00 0.00 0.06505 27000.00 16400.00 0.00 0.06513 26400.00 16600.00 0.00 0.06555 26600.00 16600.00 0.00 0.06629 26800.00 16600.00 0.00 0.06663 27000.00 16600.00 0.00 0.06670 26400.00 16800.00 0.00 0.06723 26600.00 16800.00 0.00 0.06797 26800.00 16800.00 0.00 0.06829 27000.00 16800.00 0.00 0.06833 26400.00 17000.00 0.00 0.06894 26600.00 17000.00 0.00 0.06967 26800.00 17000.00 0.00 0.06996 26400.00 17200.00 0.00 0.07061 26600.00 17200.00 0.00 0.07131 26800.00 17200.00 0.00 0.07156 26400.00 17400.00 0.00 0.07223 26600.00 17400.00 0.00 0.07289 26800.00 17400.00 0.00 0.07311 26400.00 17600.00 0.00 0.07382 26600.00 17600.00 0.00 0.07447 26800.00 17600.00 0.00 0.07467 26400.00 17800.00 0.00 0.07539 26600.00 17800.00 0.00 0.07603 26800.00 17800.00 0.00 0.07624 26400.00 18000.00 0.00 0.07697 26600.00 18000.00 0.00 0.07765 26800.00 18000.00 0.00 0.07788 26400.00 18200.00 0.00 0.07865 26600.00 18200.00 0.00 0.07937 26800.00 18200.00 0.00 0.07964 26400.00 18400.00 0.00 0.08044 26600.00 18400.00 0.00 0.08121 26800.00 18400.00 0.00 0.08153 27000.00 18400.00 0.00 0.08153 26400.00 18600.00 0.00 0.08243 26600.00 18600.00 0.00 0.08324 26800.00 18600.00 0.00 0.08358 27000.00 18600.00 0.00 0.08358 26400.00 18800.00 0.00 0.08464 26600.00 18800.00 0.00 0.08548 26800.00 18800.00 0.00 0.08581 26400.00 19000.00 0.00 0.08698 26600.00 19000.00 0.00 0.08781 26800.00 19000.00 0.00 0.08812 26400.00 19200.00 0.00 0.08930 26600.00 19200.00 0.00 0.09012 26800.00 19200.00 0.00 0.09037 26400.00 19400.00 0.00 0.09155 26600.00 19400.00 0.00 0.09233 26800.00 19400.00 0.00 0.09253 26400.00 19600.00 0.00 0.09367 26600.00 19600.00 0.00 0.09440 26800.00 19600.00 0.00 0.09454 26400.00 19800.00 0.00 0.09570 26600.00 19800.00 0.00 0.09639 26800.00 19800.00 0.00 0.09649 26400.00 20000.00 0.00 0.09780 26600.00 20000.00 0.00 0.09845 26800.00 20000.00 0.00 0.09852 26200.00 20200.00 0.00 0.09870 26400.00 20200.00 0.00 0.10001 26600.00 20200.00 0.00 0.10064 26800.00 20200.00 0.00 0.10067 26200.00 20400.00 0.00 0.10097 26400.00 20400.00 0.00 0.10226 26600.00 20400.00 0.00 0.10285 26200.00 20600.00 0.00 0.10324 26400.00 20600.00 0.00 0.10449 26600.00 20600.00 0.00 0.10504 26200.00 20800.00 0.00 0.10543 26400.00 20800.00 0.00 0.10665 26600.00 20800.00 0.00 0.10716 26200.00 21000.00 0.00 0.10751 26400.00 21000.00 0.00 0.10870 26600.00 21000.00 0.00 0.10919 26200.00 21200.00 0.00 0.10964 26400.00 21200.00 0.00 0.11083 26600.00 21200.00 0.00 0.11132 26200.00 21400.00 0.00 0.11197 26400.00 21400.00 0.00 0.11317 26600.00 21400.00 0.00 0.11366 26200.00 21600.00 0.00 0.11444 26400.00 21600.00 0.00 0.11566 26600.00 21600.00 0.00 0.11614 26200.00 21800.00 0.00 0.11701 26400.00 21800.00 0.00 0.11824 26600.00 21800.00 0.00 0.11871 26200.00 22000.00 0.00 0.11964 26400.00 22000.00 0.00 0.12087 26600.00 22000.00 0.00 0.12133 26200.00 22200.00 0.00 0.12225 26400.00 22200.00 0.00 0.12346 26600.00 22200.00 0.00 0.12388 26200.00 22400.00 0.00 0.12486 26400.00 22400.00 0.00 0.12604 26600.00 22400.00 0.00 0.12639 26200.00 22600.00 0.00 0.12762 26400.00 22600.00 0.00 0.12875 26600.00 22600.00 0.00 0.12903 26200.00 22800.00 0.00 0.13050 26400.00 22800.00 0.00 0.13157 26600.00 22800.00 0.00 0.13174 26200.00 23000.00 0.00 0.13338 26400.00 23000.00 0.00 0.13436 26600.00 23000.00 0.00 0.13442 26200.00 23200.00 0.00 0.13626 26400.00 23200.00 0.00 0.13715 26000.00 23400.00 0.00 0.13724 26200.00 23400.00 0.00 0.13910 26400.00 23400.00 0.00 0.13990 26000.00 23600.00 0.00 0.14014 26200.00 23600.00 0.00 0.14194 26400.00 23600.00 0.00 0.14264 26000.00 23800.00 0.00 0.14324 26200.00 23800.00 0.00 0.14498 26400.00 23800.00 0.00 0.14557 26000.00 24000.00 0.00 0.14658 26200.00 24000.00 0.00 0.14825 26400.00 24000.00 0.00 0.14873 26000.00 24200.00 0.00 0.14997 26200.00 24200.00 0.00 0.15155 26400.00 24200.00 0.00 0.15189 26000.00 24400.00 0.00 0.15329 26200.00 24400.00 0.00 0.15477 26400.00 24400.00 0.00 0.15495 26000.00 24600.00 0.00 0.15646 26200.00 24600.00 0.00 0.15783 26400.00 24600.00 0.00 0.15784 26000.00 24800.00 0.00 0.15943 26200.00 24800.00 0.00 0.16067 26000.00 25000.00 0.00 0.16248 26200.00 25000.00 0.00 0.16356 26000.00 25200.00 0.00 0.16585 26200.00 25200.00 0.00 0.16668 25800.00 25400.00 0.00 0.16697 26000.00 25400.00 0.00 0.16923 26200.00 25400.00 0.00 0.16969 25800.00 25600.00 0.00 0.17024 26000.00 25600.00 0.00 0.17215 25800.00 25800.00 0.00 0.17277 26000.00 25800.00 0.00 0.17418 26000.00 26000.00 0.00 0.17471 25800.00 26000.00 35.00 0.17474 25800.00 26000.00 40.00 0.17480 25800.00 26000.00 45.00 0.17483 25800.00 26000.00 50.00 0.17484 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 25856.15 26053.43 50.00 0.17504 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs/400.ctf NX, NY, NZ: 360 360 1 MODE : real