CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs/405.mrc Output diagnostic file name Micrographs/405.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 360 35.0 5.0 8000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs/405.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 1652.000 7524.000 Mean, RMS : 4306.030 234.0045 TITLE 1: emi2mrc: 405.emi Mon Jan 20 11:30:32 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 19850, Spot 4, Int 55.10%, Obj 88.07%, Dif 73.67% TITLE 3: X -444.806, Y 511.993, Z -26.464, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 121 109 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 8000.00 8000.00 0.00 -0.03515 17600.00 8000.00 0.00 -0.03428 17800.00 8000.00 0.00 -0.03318 18000.00 8000.00 0.00 -0.03206 18200.00 8000.00 0.00 -0.03096 18400.00 8000.00 0.00 -0.02984 18600.00 8000.00 0.00 -0.02866 18800.00 8000.00 0.00 -0.02737 19000.00 8000.00 0.00 -0.02599 19200.00 8000.00 0.00 -0.02456 19400.00 8000.00 0.00 -0.02315 19600.00 8000.00 0.00 -0.02181 19800.00 8000.00 0.00 -0.02051 20000.00 8000.00 0.00 -0.01923 20200.00 8000.00 0.00 -0.01794 20400.00 8000.00 0.00 -0.01665 20600.00 8000.00 0.00 -0.01535 20800.00 8000.00 0.00 -0.01405 21000.00 8000.00 0.00 -0.01274 21200.00 8000.00 0.00 -0.01139 21400.00 8000.00 0.00 -0.01001 21600.00 8000.00 0.00 -0.00862 21800.00 8000.00 0.00 -0.00730 22000.00 8000.00 0.00 -0.00607 22200.00 8000.00 0.00 -0.00493 22400.00 8000.00 0.00 -0.00378 22600.00 8000.00 0.00 -0.00251 22800.00 8000.00 0.00 -0.00102 23000.00 8000.00 0.00 0.00070 23200.00 8000.00 0.00 0.00260 23400.00 8000.00 0.00 0.00460 23600.00 8000.00 0.00 0.00665 23800.00 8000.00 0.00 0.00872 24000.00 8000.00 0.00 0.01079 24200.00 8000.00 0.00 0.01285 24400.00 8000.00 0.00 0.01486 24600.00 8000.00 0.00 0.01681 24800.00 8000.00 0.00 0.01875 25000.00 8000.00 0.00 0.02081 25200.00 8000.00 0.00 0.02309 25400.00 8000.00 0.00 0.02556 25600.00 8000.00 0.00 0.02807 25800.00 8000.00 0.00 0.03038 26000.00 8000.00 0.00 0.03221 26200.00 8000.00 0.00 0.03341 26400.00 8000.00 0.00 0.03405 26600.00 8000.00 0.00 0.03428 26800.00 8000.00 0.00 0.03429 26400.00 8200.00 0.00 0.03464 26600.00 8200.00 0.00 0.03489 26800.00 8200.00 0.00 0.03489 26400.00 8400.00 0.00 0.03518 26600.00 8400.00 0.00 0.03542 26400.00 8600.00 0.00 0.03562 26600.00 8600.00 0.00 0.03584 26400.00 8800.00 0.00 0.03594 26600.00 8800.00 0.00 0.03613 26600.00 9000.00 0.00 0.03628 26600.00 9200.00 0.00 0.03633 26600.00 9400.00 0.00 0.03633 26600.00 9600.00 0.00 0.03636 26600.00 9800.00 0.00 0.03652 26400.00 10000.00 0.00 0.03666 26600.00 10000.00 0.00 0.03685 26400.00 10200.00 0.00 0.03710 26600.00 10200.00 0.00 0.03732 26400.00 10400.00 0.00 0.03767 26600.00 10400.00 0.00 0.03790 26400.00 10600.00 0.00 0.03831 26600.00 10600.00 0.00 0.03854 26400.00 10800.00 0.00 0.03899 26600.00 10800.00 0.00 0.03919 26400.00 11000.00 0.00 0.03969 26600.00 11000.00 0.00 0.03986 26400.00 11200.00 0.00 0.04041 26600.00 11200.00 0.00 0.04054 26200.00 11400.00 0.00 0.04055 26400.00 11400.00 0.00 0.04112 26600.00 11400.00 0.00 0.04122 26200.00 11600.00 0.00 0.04126 26400.00 11600.00 0.00 0.04180 26600.00 11600.00 0.00 0.04187 26200.00 11800.00 0.00 0.04194 26400.00 11800.00 0.00 0.04246 26600.00 11800.00 0.00 0.04253 26200.00 12000.00 0.00 0.04262 26400.00 12000.00 0.00 0.04314 26600.00 12000.00 0.00 0.04322 26200.00 12200.00 0.00 0.04335 26400.00 12200.00 0.00 0.04388 26600.00 12200.00 0.00 0.04398 26200.00 12400.00 0.00 0.04419 26400.00 12400.00 0.00 0.04473 26600.00 12400.00 0.00 0.04485 26200.00 12600.00 0.00 0.04513 26400.00 12600.00 0.00 0.04568 26600.00 12600.00 0.00 0.04580 26200.00 12800.00 0.00 0.04608 26400.00 12800.00 0.00 0.04663 26600.00 12800.00 0.00 0.04676 26200.00 13000.00 0.00 0.04699 26400.00 13000.00 0.00 0.04753 26600.00 13000.00 0.00 0.04765 26200.00 13200.00 0.00 0.04780 26400.00 13200.00 0.00 0.04834 26600.00 13200.00 0.00 0.04844 26200.00 13400.00 0.00 0.04853 26400.00 13400.00 0.00 0.04906 26600.00 13400.00 0.00 0.04915 26200.00 13600.00 0.00 0.04927 26400.00 13600.00 0.00 0.04979 26600.00 13600.00 0.00 0.04989 26200.00 13800.00 0.00 0.05008 26400.00 13800.00 0.00 0.05061 26600.00 13800.00 0.00 0.05072 26200.00 14000.00 0.00 0.05097 26400.00 14000.00 0.00 0.05152 26600.00 14000.00 0.00 0.05166 26200.00 14200.00 0.00 0.05192 26400.00 14200.00 0.00 0.05251 26600.00 14200.00 0.00 0.05269 26200.00 14400.00 0.00 0.05293 26400.00 14400.00 0.00 0.05355 26600.00 14400.00 0.00 0.05378 26800.00 14400.00 0.00 0.05382 27000.00 14400.00 0.00 0.05383 26200.00 14600.00 0.00 0.05393 26400.00 14600.00 0.00 0.05460 26600.00 14600.00 0.00 0.05487 26800.00 14600.00 0.00 0.05495 27000.00 14600.00 0.00 0.05497 26400.00 14800.00 0.00 0.05568 26600.00 14800.00 0.00 0.05599 26800.00 14800.00 0.00 0.05609 27000.00 14800.00 0.00 0.05612 26400.00 15000.00 0.00 0.05685 26600.00 15000.00 0.00 0.05719 26800.00 15000.00 0.00 0.05730 27000.00 15000.00 0.00 0.05731 26200.00 15200.00 0.00 0.05734 26400.00 15200.00 0.00 0.05813 26600.00 15200.00 0.00 0.05848 26800.00 15200.00 0.00 0.05858 26200.00 15400.00 0.00 0.05871 26400.00 15400.00 0.00 0.05952 26600.00 15400.00 0.00 0.05986 26800.00 15400.00 0.00 0.05993 26200.00 15600.00 0.00 0.06022 26400.00 15600.00 0.00 0.06103 26600.00 15600.00 0.00 0.06136 26800.00 15600.00 0.00 0.06139 26200.00 15800.00 0.00 0.06186 26400.00 15800.00 0.00 0.06266 26600.00 15800.00 0.00 0.06295 26200.00 16000.00 0.00 0.06359 26400.00 16000.00 0.00 0.06436 26600.00 16000.00 0.00 0.06461 26200.00 16200.00 0.00 0.06541 26400.00 16200.00 0.00 0.06615 26600.00 16200.00 0.00 0.06635 26200.00 16400.00 0.00 0.06728 26400.00 16400.00 0.00 0.06797 26600.00 16400.00 0.00 0.06812 26200.00 16600.00 0.00 0.06909 26400.00 16600.00 0.00 0.06974 26600.00 16600.00 0.00 0.06984 26200.00 16800.00 0.00 0.07084 26400.00 16800.00 0.00 0.07145 26600.00 16800.00 0.00 0.07152 26200.00 17000.00 0.00 0.07255 26400.00 17000.00 0.00 0.07313 26600.00 17000.00 0.00 0.07318 26200.00 17200.00 0.00 0.07426 26400.00 17200.00 0.00 0.07484 26600.00 17200.00 0.00 0.07487 26200.00 17400.00 0.00 0.07611 26400.00 17400.00 0.00 0.07668 26600.00 17400.00 0.00 0.07671 26000.00 17600.00 0.00 0.07681 26200.00 17600.00 0.00 0.07814 26400.00 17600.00 0.00 0.07871 26600.00 17600.00 0.00 0.07874 26000.00 17800.00 0.00 0.07896 26200.00 17800.00 0.00 0.08030 26400.00 17800.00 0.00 0.08087 26600.00 17800.00 0.00 0.08090 26000.00 18000.00 0.00 0.08117 26200.00 18000.00 0.00 0.08251 26400.00 18000.00 0.00 0.08309 26600.00 18000.00 0.00 0.08310 26000.00 18200.00 0.00 0.08336 26200.00 18200.00 0.00 0.08471 26400.00 18200.00 0.00 0.08527 26000.00 18400.00 0.00 0.08545 26200.00 18400.00 0.00 0.08679 26400.00 18400.00 0.00 0.08733 26000.00 18600.00 0.00 0.08747 26200.00 18600.00 0.00 0.08880 26400.00 18600.00 0.00 0.08930 26000.00 18800.00 0.00 0.08950 26200.00 18800.00 0.00 0.09079 26400.00 18800.00 0.00 0.09125 26000.00 19000.00 0.00 0.09152 26200.00 19000.00 0.00 0.09279 26400.00 19000.00 0.00 0.09320 26000.00 19200.00 0.00 0.09353 26200.00 19200.00 0.00 0.09479 26400.00 19200.00 0.00 0.09517 26000.00 19400.00 0.00 0.09560 26200.00 19400.00 0.00 0.09685 26400.00 19400.00 0.00 0.09721 26000.00 19600.00 0.00 0.09771 26200.00 19600.00 0.00 0.09895 26400.00 19600.00 0.00 0.09928 26000.00 19800.00 0.00 0.09985 26200.00 19800.00 0.00 0.10108 26400.00 19800.00 0.00 0.10138 26000.00 20000.00 0.00 0.10207 26200.00 20000.00 0.00 0.10329 26400.00 20000.00 0.00 0.10357 26000.00 20200.00 0.00 0.10435 26200.00 20200.00 0.00 0.10556 26400.00 20200.00 0.00 0.10583 26000.00 20400.00 0.00 0.10659 26200.00 20400.00 0.00 0.10780 26400.00 20400.00 0.00 0.10805 26000.00 20600.00 0.00 0.10882 26200.00 20600.00 0.00 0.11004 26400.00 20600.00 0.00 0.11026 26000.00 20800.00 0.00 0.11107 26200.00 20800.00 0.00 0.11227 26400.00 20800.00 0.00 0.11247 26000.00 21000.00 0.00 0.11333 26200.00 21000.00 0.00 0.11451 26400.00 21000.00 0.00 0.11467 26000.00 21200.00 0.00 0.11571 26200.00 21200.00 0.00 0.11687 26400.00 21200.00 0.00 0.11698 26000.00 21400.00 0.00 0.11825 26200.00 21400.00 0.00 0.11937 26400.00 21400.00 0.00 0.11944 26000.00 21600.00 0.00 0.12078 26200.00 21600.00 0.00 0.12187 26400.00 21600.00 0.00 0.12188 26000.00 21800.00 0.00 0.12323 26200.00 21800.00 0.00 0.12428 26000.00 22000.00 0.00 0.12560 26200.00 22000.00 0.00 0.12663 26000.00 22200.00 0.00 0.12792 26200.00 22200.00 0.00 0.12891 26000.00 22400.00 0.00 0.13029 26200.00 22400.00 0.00 0.13126 26000.00 22600.00 0.00 0.13293 26200.00 22600.00 0.00 0.13385 26000.00 22800.00 0.00 0.13577 26200.00 22800.00 0.00 0.13664 26000.00 23000.00 0.00 0.13869 26200.00 23000.00 0.00 0.13947 26000.00 23200.00 0.00 0.14166 26200.00 23200.00 0.00 0.14233 25800.00 23400.00 0.00 0.14249 26000.00 23400.00 0.00 0.14467 26200.00 23400.00 0.00 0.14520 25800.00 23600.00 0.00 0.14565 26000.00 23600.00 0.00 0.14773 26200.00 23600.00 0.00 0.14813 25800.00 23800.00 0.00 0.14907 26000.00 23800.00 0.00 0.15104 26200.00 23800.00 0.00 0.15128 25800.00 24000.00 0.00 0.15273 26000.00 24000.00 0.00 0.15458 26200.00 24000.00 0.00 0.15465 25800.00 24200.00 0.00 0.15637 26000.00 24200.00 0.00 0.15809 25800.00 24400.00 0.00 0.15988 26000.00 24400.00 0.00 0.16146 25800.00 24600.00 0.00 0.16321 26000.00 24600.00 0.00 0.16464 25800.00 24800.00 0.00 0.16636 26000.00 24800.00 0.00 0.16760 25800.00 25000.00 0.00 0.16958 26000.00 25000.00 0.00 0.17061 25800.00 25200.00 0.00 0.17303 26000.00 25200.00 0.00 0.17375 25600.00 25400.00 0.00 0.17386 25800.00 25400.00 0.00 0.17621 26000.00 25400.00 0.00 0.17652 25600.00 25600.00 0.00 0.17652 25800.00 25600.00 0.00 0.17846 25800.00 25800.00 0.00 0.17935 25600.00 26000.00 40.00 0.17938 25600.00 26000.00 45.00 0.17947 25600.00 26000.00 50.00 0.17951 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 25694.77 25923.11 51.47 0.17975 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs/405.ctf NX, NY, NZ: 360 360 1 MODE : real