CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs/406.mrc Output diagnostic file name Micrographs/406.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 360 35.0 5.0 8000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs/406.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2140.000 8306.000 Mean, RMS : 4331.749 222.3986 TITLE 1: emi2mrc: 406.emi Mon Jan 20 11:31:34 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 19850, Spot 4, Int 55.10%, Obj 88.07%, Dif 73.67% TITLE 3: X -446.174, Y 509.512, Z -26.464, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 121 120 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 8000.00 8000.00 0.00 -0.03823 17400.00 8000.00 0.00 -0.03813 17600.00 8000.00 0.00 -0.03753 17800.00 8000.00 0.00 -0.03682 18000.00 8000.00 0.00 -0.03594 18200.00 8000.00 0.00 -0.03491 18400.00 8000.00 0.00 -0.03378 18600.00 8000.00 0.00 -0.03264 18800.00 8000.00 0.00 -0.03156 19000.00 8000.00 0.00 -0.03053 19200.00 8000.00 0.00 -0.02946 19400.00 8000.00 0.00 -0.02828 19600.00 8000.00 0.00 -0.02697 19800.00 8000.00 0.00 -0.02557 20000.00 8000.00 0.00 -0.02419 20200.00 8000.00 0.00 -0.02287 20400.00 8000.00 0.00 -0.02159 20600.00 8000.00 0.00 -0.02031 20800.00 8000.00 0.00 -0.01899 21000.00 8000.00 0.00 -0.01763 21200.00 8000.00 0.00 -0.01628 21400.00 8000.00 0.00 -0.01498 21600.00 8000.00 0.00 -0.01372 21800.00 8000.00 0.00 -0.01246 22000.00 8000.00 0.00 -0.01115 22200.00 8000.00 0.00 -0.00976 22400.00 8000.00 0.00 -0.00830 22600.00 8000.00 0.00 -0.00684 22800.00 8000.00 0.00 -0.00539 23000.00 8000.00 0.00 -0.00395 23200.00 8000.00 0.00 -0.00247 23400.00 8000.00 0.00 -0.00095 23600.00 8000.00 0.00 0.00064 23800.00 8000.00 0.00 0.00225 24000.00 8000.00 0.00 0.00390 24200.00 8000.00 0.00 0.00558 24400.00 8000.00 0.00 0.00733 24600.00 8000.00 0.00 0.00916 24800.00 8000.00 0.00 0.01104 25000.00 8000.00 0.00 0.01296 25200.00 8000.00 0.00 0.01491 25400.00 8000.00 0.00 0.01693 25600.00 8000.00 0.00 0.01909 25800.00 8000.00 0.00 0.02144 26000.00 8000.00 0.00 0.02392 26200.00 8000.00 0.00 0.02632 26400.00 8000.00 0.00 0.02842 26600.00 8000.00 0.00 0.02998 26800.00 8000.00 0.00 0.03091 27000.00 8000.00 0.00 0.03130 27200.00 8000.00 0.00 0.03130 27000.00 8200.00 0.00 0.03153 27000.00 8400.00 0.00 0.03175 27000.00 8600.00 0.00 0.03197 27000.00 8800.00 0.00 0.03220 27000.00 9000.00 0.00 0.03245 27000.00 9200.00 0.00 0.03275 26800.00 9400.00 0.00 0.03278 27000.00 9400.00 0.00 0.03311 26800.00 9600.00 0.00 0.03317 27000.00 9600.00 0.00 0.03350 26800.00 9800.00 0.00 0.03356 27000.00 9800.00 0.00 0.03389 26800.00 10000.00 0.00 0.03391 27000.00 10000.00 0.00 0.03423 27000.00 10200.00 0.00 0.03447 27000.00 10400.00 0.00 0.03462 27000.00 10600.00 0.00 0.03477 27200.00 10600.00 0.00 0.03478 27000.00 10800.00 0.00 0.03498 27200.00 10800.00 0.00 0.03501 26800.00 11000.00 0.00 0.03503 27000.00 11000.00 0.00 0.03534 27200.00 11000.00 0.00 0.03539 26800.00 11200.00 0.00 0.03554 27000.00 11200.00 0.00 0.03588 27200.00 11200.00 0.00 0.03596 26800.00 11400.00 0.00 0.03618 27000.00 11400.00 0.00 0.03655 27200.00 11400.00 0.00 0.03666 27400.00 11400.00 0.00 0.03668 27600.00 11400.00 0.00 0.03669 26800.00 11600.00 0.00 0.03688 27000.00 11600.00 0.00 0.03729 27200.00 11600.00 0.00 0.03744 27400.00 11600.00 0.00 0.03749 27600.00 11600.00 0.00 0.03752 26800.00 11800.00 0.00 0.03761 27000.00 11800.00 0.00 0.03805 27200.00 11800.00 0.00 0.03824 27400.00 11800.00 0.00 0.03832 27600.00 11800.00 0.00 0.03835 27000.00 12000.00 0.00 0.03882 27200.00 12000.00 0.00 0.03904 27400.00 12000.00 0.00 0.03913 27600.00 12000.00 0.00 0.03917 27000.00 12200.00 0.00 0.03960 27200.00 12200.00 0.00 0.03985 27400.00 12200.00 0.00 0.03995 27600.00 12200.00 0.00 0.03998 27000.00 12400.00 0.00 0.04046 27200.00 12400.00 0.00 0.04073 27400.00 12400.00 0.00 0.04084 27600.00 12400.00 0.00 0.04084 27000.00 12600.00 0.00 0.04141 27200.00 12600.00 0.00 0.04169 27400.00 12600.00 0.00 0.04178 26800.00 12800.00 0.00 0.04181 27000.00 12800.00 0.00 0.04242 27200.00 12800.00 0.00 0.04269 27400.00 12800.00 0.00 0.04275 26800.00 13000.00 0.00 0.04285 27000.00 13000.00 0.00 0.04345 27200.00 13000.00 0.00 0.04370 27400.00 13000.00 0.00 0.04371 26800.00 13200.00 0.00 0.04388 27000.00 13200.00 0.00 0.04447 27200.00 13200.00 0.00 0.04468 26800.00 13400.00 0.00 0.04487 27000.00 13400.00 0.00 0.04543 27200.00 13400.00 0.00 0.04560 26800.00 13600.00 0.00 0.04585 27000.00 13600.00 0.00 0.04638 27200.00 13600.00 0.00 0.04649 26800.00 13800.00 0.00 0.04684 27000.00 13800.00 0.00 0.04731 27200.00 13800.00 0.00 0.04736 26800.00 14000.00 0.00 0.04780 27000.00 14000.00 0.00 0.04822 27200.00 14000.00 0.00 0.04822 26800.00 14200.00 0.00 0.04874 27000.00 14200.00 0.00 0.04911 26800.00 14400.00 0.00 0.04966 27000.00 14400.00 0.00 0.05000 26800.00 14600.00 0.00 0.05057 27000.00 14600.00 0.00 0.05089 26800.00 14800.00 0.00 0.05151 27000.00 14800.00 0.00 0.05184 26800.00 15000.00 0.00 0.05256 27000.00 15000.00 0.00 0.05291 26800.00 15200.00 0.00 0.05371 27000.00 15200.00 0.00 0.05409 27200.00 15200.00 0.00 0.05410 26800.00 15400.00 0.00 0.05496 27000.00 15400.00 0.00 0.05537 27200.00 15400.00 0.00 0.05541 26800.00 15600.00 0.00 0.05632 27000.00 15600.00 0.00 0.05677 27200.00 15600.00 0.00 0.05683 26800.00 15800.00 0.00 0.05778 27000.00 15800.00 0.00 0.05824 27200.00 15800.00 0.00 0.05831 26800.00 16000.00 0.00 0.05931 27000.00 16000.00 0.00 0.05977 27200.00 16000.00 0.00 0.05983 26600.00 16200.00 0.00 0.05987 26800.00 16200.00 0.00 0.06095 27000.00 16200.00 0.00 0.06140 27200.00 16200.00 0.00 0.06144 26600.00 16400.00 0.00 0.06160 26800.00 16400.00 0.00 0.06268 27000.00 16400.00 0.00 0.06311 26600.00 16600.00 0.00 0.06337 26800.00 16600.00 0.00 0.06443 27000.00 16600.00 0.00 0.06483 26600.00 16800.00 0.00 0.06512 26800.00 16800.00 0.00 0.06616 27000.00 16800.00 0.00 0.06652 26600.00 17000.00 0.00 0.06682 26800.00 17000.00 0.00 0.06782 27000.00 17000.00 0.00 0.06812 26600.00 17200.00 0.00 0.06841 26800.00 17200.00 0.00 0.06936 27000.00 17200.00 0.00 0.06961 26600.00 17400.00 0.00 0.06993 26800.00 17400.00 0.00 0.07083 27000.00 17400.00 0.00 0.07105 26600.00 17600.00 0.00 0.07144 26800.00 17600.00 0.00 0.07231 27000.00 17600.00 0.00 0.07251 26600.00 17800.00 0.00 0.07295 26800.00 17800.00 0.00 0.07381 27000.00 17800.00 0.00 0.07401 26600.00 18000.00 0.00 0.07451 26800.00 18000.00 0.00 0.07537 27000.00 18000.00 0.00 0.07556 26600.00 18200.00 0.00 0.07614 26800.00 18200.00 0.00 0.07699 27000.00 18200.00 0.00 0.07719 26600.00 18400.00 0.00 0.07780 26800.00 18400.00 0.00 0.07865 27000.00 18400.00 0.00 0.07883 26600.00 18600.00 0.00 0.07952 26800.00 18600.00 0.00 0.08034 27000.00 18600.00 0.00 0.08051 26600.00 18800.00 0.00 0.08130 26800.00 18800.00 0.00 0.08210 27000.00 18800.00 0.00 0.08225 26600.00 19000.00 0.00 0.08311 26800.00 19000.00 0.00 0.08389 27000.00 19000.00 0.00 0.08402 26600.00 19200.00 0.00 0.08492 26800.00 19200.00 0.00 0.08569 27000.00 19200.00 0.00 0.08582 26600.00 19400.00 0.00 0.08675 26800.00 19400.00 0.00 0.08753 27000.00 19400.00 0.00 0.08767 26600.00 19600.00 0.00 0.08861 26800.00 19600.00 0.00 0.08943 27000.00 19600.00 0.00 0.08960 26600.00 19800.00 0.00 0.09054 26800.00 19800.00 0.00 0.09141 27000.00 19800.00 0.00 0.09163 26600.00 20000.00 0.00 0.09264 26800.00 20000.00 0.00 0.09355 27000.00 20000.00 0.00 0.09381 26600.00 20200.00 0.00 0.09488 26800.00 20200.00 0.00 0.09582 27000.00 20200.00 0.00 0.09608 26600.00 20400.00 0.00 0.09715 26800.00 20400.00 0.00 0.09809 27000.00 20400.00 0.00 0.09832 26600.00 20600.00 0.00 0.09940 26800.00 20600.00 0.00 0.10030 27000.00 20600.00 0.00 0.10048 26600.00 20800.00 0.00 0.10157 26800.00 20800.00 0.00 0.10243 27000.00 20800.00 0.00 0.10253 26600.00 21000.00 0.00 0.10364 26800.00 21000.00 0.00 0.10444 27000.00 21000.00 0.00 0.10448 26600.00 21200.00 0.00 0.10570 26800.00 21200.00 0.00 0.10645 26600.00 21400.00 0.00 0.10782 26800.00 21400.00 0.00 0.10852 26600.00 21600.00 0.00 0.10992 26800.00 21600.00 0.00 0.11060 26600.00 21800.00 0.00 0.11200 26800.00 21800.00 0.00 0.11265 26600.00 22000.00 0.00 0.11411 26800.00 22000.00 0.00 0.11474 26600.00 22200.00 0.00 0.11624 26800.00 22200.00 0.00 0.11686 26600.00 22400.00 0.00 0.11850 26800.00 22400.00 0.00 0.11908 26400.00 22600.00 0.00 0.11934 26600.00 22600.00 0.00 0.12104 26800.00 22600.00 0.00 0.12156 26400.00 22800.00 0.00 0.12214 26600.00 22800.00 0.00 0.12378 26800.00 22800.00 0.00 0.12420 26400.00 23000.00 0.00 0.12499 26600.00 23000.00 0.00 0.12655 26800.00 23000.00 0.00 0.12686 26400.00 23200.00 0.00 0.12783 26600.00 23200.00 0.00 0.12932 26800.00 23200.00 0.00 0.12952 26400.00 23400.00 0.00 0.13063 26600.00 23400.00 0.00 0.13204 26800.00 23400.00 0.00 0.13215 26400.00 23600.00 0.00 0.13341 26600.00 23600.00 0.00 0.13475 26800.00 23600.00 0.00 0.13477 26400.00 23800.00 0.00 0.13640 26600.00 23800.00 0.00 0.13768 26400.00 24000.00 0.00 0.13971 26600.00 24000.00 0.00 0.14091 26400.00 24200.00 0.00 0.14317 26600.00 24200.00 0.00 0.14427 26400.00 24400.00 0.00 0.14666 26600.00 24400.00 0.00 0.14765 26200.00 24600.00 0.00 0.14769 26400.00 24600.00 0.00 0.15008 26600.00 24600.00 0.00 0.15094 26200.00 24800.00 0.00 0.15105 26400.00 24800.00 0.00 0.15335 26600.00 24800.00 0.00 0.15406 26200.00 25000.00 0.00 0.15453 26400.00 25000.00 0.00 0.15672 26600.00 25000.00 0.00 0.15724 26200.00 25200.00 0.00 0.15847 26400.00 25200.00 0.00 0.16046 26600.00 25200.00 0.00 0.16073 26200.00 25400.00 0.00 0.16273 26400.00 25400.00 0.00 0.16445 26200.00 25600.00 0.00 0.16705 26400.00 25600.00 0.00 0.16838 26200.00 25800.00 0.00 0.17100 26400.00 25800.00 0.00 0.17183 26200.00 26000.00 0.00 0.17379 26400.00 26000.00 0.00 0.17404 26200.00 26200.00 0.00 0.17487 26200.00 26400.00 15.00 0.17489 26200.00 26400.00 20.00 0.17503 26200.00 26400.00 25.00 0.17516 26200.00 26400.00 30.00 0.17526 26000.00 26400.00 35.00 0.17528 26200.00 26400.00 35.00 0.17534 26000.00 26400.00 40.00 0.17541 26000.00 26400.00 45.00 0.17549 26000.00 26400.00 50.00 0.17552 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 26089.71 26406.05 48.46 0.17572 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs/406.ctf NX, NY, NZ: 360 360 1 MODE : real