CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs/407.mrc Output diagnostic file name Micrographs/407.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 360 35.0 5.0 8000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs/407.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2162.000 8582.000 Mean, RMS : 4363.307 225.2983 TITLE 1: emi2mrc: 407.emi Mon Jan 20 11:32:26 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 19850, Spot 4, Int 55.10%, Obj 88.07%, Dif 73.67% TITLE 3: X -449.469, Y 505.563, Z -26.464, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 121 120 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 8000.00 8000.00 0.00 -0.03110 14600.00 8000.00 0.00 -0.03080 14800.00 8000.00 0.00 -0.03023 15000.00 8000.00 0.00 -0.02957 15200.00 8000.00 0.00 -0.02882 15400.00 8000.00 0.00 -0.02801 15600.00 8000.00 0.00 -0.02715 15800.00 8000.00 0.00 -0.02624 16000.00 8000.00 0.00 -0.02530 16200.00 8000.00 0.00 -0.02434 16400.00 8000.00 0.00 -0.02338 16600.00 8000.00 0.00 -0.02242 16800.00 8000.00 0.00 -0.02141 17000.00 8000.00 0.00 -0.02032 17200.00 8000.00 0.00 -0.01908 17400.00 8000.00 0.00 -0.01769 17600.00 8000.00 0.00 -0.01618 17800.00 8000.00 0.00 -0.01458 18000.00 8000.00 0.00 -0.01294 18200.00 8000.00 0.00 -0.01129 18400.00 8000.00 0.00 -0.00965 18600.00 8000.00 0.00 -0.00803 18800.00 8000.00 0.00 -0.00642 19000.00 8000.00 0.00 -0.00480 19200.00 8000.00 0.00 -0.00314 19400.00 8000.00 0.00 -0.00140 19600.00 8000.00 0.00 0.00038 19800.00 8000.00 0.00 0.00217 20000.00 8000.00 0.00 0.00390 20200.00 8000.00 0.00 0.00554 20400.00 8000.00 0.00 0.00708 20600.00 8000.00 0.00 0.00858 20800.00 8000.00 0.00 0.01010 21000.00 8000.00 0.00 0.01168 21200.00 8000.00 0.00 0.01335 21400.00 8000.00 0.00 0.01509 21600.00 8000.00 0.00 0.01691 21800.00 8000.00 0.00 0.01881 22000.00 8000.00 0.00 0.02082 22200.00 8000.00 0.00 0.02294 22400.00 8000.00 0.00 0.02517 22600.00 8000.00 0.00 0.02745 22800.00 8000.00 0.00 0.02976 23000.00 8000.00 0.00 0.03213 23200.00 8000.00 0.00 0.03464 23400.00 8000.00 0.00 0.03736 23600.00 8000.00 0.00 0.04028 23800.00 8000.00 0.00 0.04326 24000.00 8000.00 0.00 0.04605 24200.00 8000.00 0.00 0.04835 24400.00 8000.00 0.00 0.04998 24600.00 8000.00 0.00 0.05095 24800.00 8000.00 0.00 0.05139 25000.00 8000.00 0.00 0.05153 25200.00 8000.00 0.00 0.05157 24800.00 8200.00 0.00 0.05187 25000.00 8200.00 0.00 0.05197 24800.00 8400.00 0.00 0.05227 25000.00 8400.00 0.00 0.05233 24600.00 8600.00 0.00 0.05236 24800.00 8600.00 0.00 0.05269 25000.00 8600.00 0.00 0.05270 24600.00 8800.00 0.00 0.05285 24800.00 8800.00 0.00 0.05313 24600.00 9000.00 0.00 0.05333 24800.00 9000.00 0.00 0.05357 24600.00 9200.00 0.00 0.05381 24800.00 9200.00 0.00 0.05400 24600.00 9400.00 0.00 0.05424 24800.00 9400.00 0.00 0.05438 24600.00 9600.00 0.00 0.05460 24800.00 9600.00 0.00 0.05471 24600.00 9800.00 0.00 0.05494 24800.00 9800.00 0.00 0.05503 24600.00 10000.00 0.00 0.05530 24800.00 10000.00 0.00 0.05538 24600.00 10200.00 0.00 0.05568 24800.00 10200.00 0.00 0.05578 24600.00 10400.00 0.00 0.05614 24800.00 10400.00 0.00 0.05628 25400.00 10400.00 0.00 0.05631 25600.00 10400.00 0.00 0.05633 24600.00 10600.00 0.00 0.05675 24800.00 10600.00 0.00 0.05693 25000.00 10600.00 0.00 0.05694 25200.00 10600.00 0.00 0.05701 25400.00 10600.00 0.00 0.05711 25600.00 10600.00 0.00 0.05715 24600.00 10800.00 0.00 0.05750 24800.00 10800.00 0.00 0.05773 25000.00 10800.00 0.00 0.05779 25200.00 10800.00 0.00 0.05789 25400.00 10800.00 0.00 0.05803 25600.00 10800.00 0.00 0.05807 24600.00 11000.00 0.00 0.05842 24800.00 11000.00 0.00 0.05868 25000.00 11000.00 0.00 0.05876 25200.00 11000.00 0.00 0.05889 25400.00 11000.00 0.00 0.05902 25600.00 11000.00 0.00 0.05905 24600.00 11200.00 0.00 0.05944 24800.00 11200.00 0.00 0.05972 25000.00 11200.00 0.00 0.05982 25200.00 11200.00 0.00 0.05994 25400.00 11200.00 0.00 0.06006 24600.00 11400.00 0.00 0.06047 24800.00 11400.00 0.00 0.06076 25000.00 11400.00 0.00 0.06085 25200.00 11400.00 0.00 0.06096 25400.00 11400.00 0.00 0.06105 24600.00 11600.00 0.00 0.06145 24800.00 11600.00 0.00 0.06174 25000.00 11600.00 0.00 0.06183 25200.00 11600.00 0.00 0.06192 25400.00 11600.00 0.00 0.06197 24600.00 11800.00 0.00 0.06241 24800.00 11800.00 0.00 0.06270 25000.00 11800.00 0.00 0.06278 25200.00 11800.00 0.00 0.06284 25400.00 11800.00 0.00 0.06287 24600.00 12000.00 0.00 0.06336 24800.00 12000.00 0.00 0.06365 25000.00 12000.00 0.00 0.06372 25200.00 12000.00 0.00 0.06377 25400.00 12000.00 0.00 0.06378 24600.00 12200.00 0.00 0.06435 24800.00 12200.00 0.00 0.06464 25000.00 12200.00 0.00 0.06471 25200.00 12200.00 0.00 0.06475 24600.00 12400.00 0.00 0.06543 24800.00 12400.00 0.00 0.06572 25000.00 12400.00 0.00 0.06579 25200.00 12400.00 0.00 0.06582 24600.00 12600.00 0.00 0.06653 24800.00 12600.00 0.00 0.06682 25000.00 12600.00 0.00 0.06688 25200.00 12600.00 0.00 0.06690 24600.00 12800.00 0.00 0.06758 24800.00 12800.00 0.00 0.06787 25000.00 12800.00 0.00 0.06792 25200.00 12800.00 0.00 0.06793 24600.00 13000.00 0.00 0.06860 24800.00 13000.00 0.00 0.06888 25000.00 13000.00 0.00 0.06892 25200.00 13000.00 0.00 0.06893 24600.00 13200.00 0.00 0.06964 24800.00 13200.00 0.00 0.06991 25000.00 13200.00 0.00 0.06995 25200.00 13200.00 0.00 0.06995 24400.00 13400.00 0.00 0.06997 24600.00 13400.00 0.00 0.07077 24800.00 13400.00 0.00 0.07105 25000.00 13400.00 0.00 0.07109 25200.00 13400.00 0.00 0.07110 24400.00 13600.00 0.00 0.07129 24600.00 13600.00 0.00 0.07210 24800.00 13600.00 0.00 0.07239 25000.00 13600.00 0.00 0.07244 25200.00 13600.00 0.00 0.07247 25400.00 13600.00 0.00 0.07247 24400.00 13800.00 0.00 0.07279 24600.00 13800.00 0.00 0.07362 24800.00 13800.00 0.00 0.07393 25000.00 13800.00 0.00 0.07400 25200.00 13800.00 0.00 0.07404 25400.00 13800.00 0.00 0.07406 24400.00 14000.00 0.00 0.07433 24600.00 14000.00 0.00 0.07519 24800.00 14000.00 0.00 0.07552 25000.00 14000.00 0.00 0.07560 25200.00 14000.00 0.00 0.07565 25400.00 14000.00 0.00 0.07566 24400.00 14200.00 0.00 0.07581 24600.00 14200.00 0.00 0.07669 24800.00 14200.00 0.00 0.07704 25000.00 14200.00 0.00 0.07713 25200.00 14200.00 0.00 0.07717 25400.00 14200.00 0.00 0.07718 24400.00 14400.00 0.00 0.07720 24600.00 14400.00 0.00 0.07809 24800.00 14400.00 0.00 0.07845 25000.00 14400.00 0.00 0.07854 25200.00 14400.00 0.00 0.07858 24600.00 14600.00 0.00 0.07942 24800.00 14600.00 0.00 0.07979 25000.00 14600.00 0.00 0.07988 25200.00 14600.00 0.00 0.07992 24600.00 14800.00 0.00 0.08082 24800.00 14800.00 0.00 0.08120 25000.00 14800.00 0.00 0.08129 25200.00 14800.00 0.00 0.08131 24400.00 15000.00 0.00 0.08147 24600.00 15000.00 0.00 0.08242 24800.00 15000.00 0.00 0.08280 25000.00 15000.00 0.00 0.08289 25200.00 15000.00 0.00 0.08290 24400.00 15200.00 0.00 0.08322 24600.00 15200.00 0.00 0.08418 24800.00 15200.00 0.00 0.08457 25000.00 15200.00 0.00 0.08465 24400.00 15400.00 0.00 0.08504 24600.00 15400.00 0.00 0.08602 24800.00 15400.00 0.00 0.08640 25000.00 15400.00 0.00 0.08646 24400.00 15600.00 0.00 0.08686 24600.00 15600.00 0.00 0.08784 24800.00 15600.00 0.00 0.08821 25000.00 15600.00 0.00 0.08824 24400.00 15800.00 0.00 0.08862 24600.00 15800.00 0.00 0.08960 24800.00 15800.00 0.00 0.08995 25000.00 15800.00 0.00 0.08995 24400.00 16000.00 0.00 0.09037 24600.00 16000.00 0.00 0.09134 24800.00 16000.00 0.00 0.09167 24400.00 16200.00 0.00 0.09223 24600.00 16200.00 0.00 0.09319 24800.00 16200.00 0.00 0.09350 24400.00 16400.00 0.00 0.09421 24600.00 16400.00 0.00 0.09516 24800.00 16400.00 0.00 0.09545 24400.00 16600.00 0.00 0.09626 24600.00 16600.00 0.00 0.09721 24800.00 16600.00 0.00 0.09748 24400.00 16800.00 0.00 0.09836 24600.00 16800.00 0.00 0.09930 24800.00 16800.00 0.00 0.09956 24400.00 17000.00 0.00 0.10047 24600.00 17000.00 0.00 0.10141 24800.00 17000.00 0.00 0.10166 24400.00 17200.00 0.00 0.10262 24600.00 17200.00 0.00 0.10357 24800.00 17200.00 0.00 0.10381 24400.00 17400.00 0.00 0.10494 24600.00 17400.00 0.00 0.10589 24800.00 17400.00 0.00 0.10611 24400.00 17600.00 0.00 0.10749 24600.00 17600.00 0.00 0.10842 24800.00 17600.00 0.00 0.10861 24400.00 17800.00 0.00 0.11015 24600.00 17800.00 0.00 0.11106 24800.00 17800.00 0.00 0.11121 24400.00 18000.00 0.00 0.11281 24600.00 18000.00 0.00 0.11369 24800.00 18000.00 0.00 0.11381 24400.00 18200.00 0.00 0.11541 24600.00 18200.00 0.00 0.11627 24800.00 18200.00 0.00 0.11635 24400.00 18400.00 0.00 0.11790 24600.00 18400.00 0.00 0.11874 24800.00 18400.00 0.00 0.11877 24400.00 18600.00 0.00 0.12037 24600.00 18600.00 0.00 0.12117 24200.00 18800.00 0.00 0.12119 24400.00 18800.00 0.00 0.12295 24600.00 18800.00 0.00 0.12371 24200.00 19000.00 0.00 0.12385 24400.00 19000.00 0.00 0.12558 24600.00 19000.00 0.00 0.12628 24200.00 19200.00 0.00 0.12644 24400.00 19200.00 0.00 0.12815 24600.00 19200.00 0.00 0.12880 24200.00 19400.00 0.00 0.12896 24400.00 19400.00 0.00 0.13064 24600.00 19400.00 0.00 0.13125 24200.00 19600.00 0.00 0.13132 24400.00 19600.00 0.00 0.13299 24600.00 19600.00 0.00 0.13356 24200.00 19800.00 0.00 0.13361 24400.00 19800.00 0.00 0.13526 24600.00 19800.00 0.00 0.13579 24200.00 20000.00 0.00 0.13606 24400.00 20000.00 0.00 0.13770 24600.00 20000.00 0.00 0.13819 24200.00 20200.00 0.00 0.13875 24400.00 20200.00 0.00 0.14037 24600.00 20200.00 0.00 0.14081 24200.00 20400.00 0.00 0.14157 24400.00 20400.00 0.00 0.14316 24600.00 20400.00 0.00 0.14352 24200.00 20600.00 0.00 0.14445 24400.00 20600.00 0.00 0.14598 24600.00 20600.00 0.00 0.14625 24200.00 20800.00 0.00 0.14731 24400.00 20800.00 0.00 0.14877 24600.00 20800.00 0.00 0.14894 24200.00 21000.00 0.00 0.15008 24400.00 21000.00 0.00 0.15145 24600.00 21000.00 0.00 0.15149 24200.00 21200.00 0.00 0.15290 24400.00 21200.00 0.00 0.15416 24200.00 21400.00 0.00 0.15594 24400.00 21400.00 0.00 0.15708 24200.00 21600.00 0.00 0.15911 24400.00 21600.00 0.00 0.16012 24200.00 21800.00 0.00 0.16230 24400.00 21800.00 0.00 0.16317 24200.00 22000.00 0.00 0.16547 24400.00 22000.00 0.00 0.16622 24000.00 22200.00 0.00 0.16630 24200.00 22200.00 0.00 0.16853 24400.00 22200.00 0.00 0.16914 24000.00 22400.00 0.00 0.16946 24200.00 22400.00 0.00 0.17157 24400.00 22400.00 0.00 0.17202 24000.00 22600.00 0.00 0.17286 24200.00 22600.00 0.00 0.17482 24400.00 22600.00 0.00 0.17508 24000.00 22800.00 0.00 0.17642 24200.00 22800.00 0.00 0.17819 24400.00 22800.00 0.00 0.17822 24000.00 23000.00 0.00 0.17991 24200.00 23000.00 0.00 0.18145 24000.00 23200.00 0.00 0.18319 24200.00 23200.00 0.00 0.18446 24000.00 23400.00 0.00 0.18595 24200.00 23400.00 0.00 0.18692 24000.00 23600.00 0.00 0.18794 24200.00 23600.00 0.00 0.18860 24000.00 23800.00 0.00 0.18936 24200.00 23800.00 0.00 0.18970 24000.00 24000.00 0.00 0.19025 24000.00 24200.00 10.00 0.19034 24000.00 24200.00 15.00 0.19044 24000.00 24200.00 20.00 0.19054 24000.00 24200.00 25.00 0.19062 24000.00 24200.00 30.00 0.19069 24000.00 24200.00 35.00 0.19074 24000.00 24200.00 40.00 0.19078 24000.00 24200.00 45.00 0.19079 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 23945.20 24190.91 48.23 0.19085 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs/407.ctf NX, NY, NZ: 360 360 1 MODE : real